单细胞测序技术已然成为生命科学的一大热点,经过几年的发展,该技术已日臻成熟完善,成功实现分析单个细胞中的基因组、转录组和表观遗传学等信息,获取高分辨率细胞间变异信息。高灵敏度的单细胞RNA测序(scRNA-Seq)方法能够通过分析复杂组织中的单个细胞的转录体,为了解不同亚群对治疗或环境线索的反应提供了一种理想的方法。
此外,该技术还可以用于细胞分化、增殖和肿瘤发生过程中细胞功能和异质性的深度研究。
5月7日 19:00
哈尔滨工业大学生命科学与技术学院张岩教授,清华大学自动化系古槿副教授,Illumina资深行业市场经理王亚俊博士,北京交通大学软件学院李翔宇博士,将围绕单细胞测序技术发展趋势,工作流程和最新癌症研究应用进行讨论,并结合国际最新进展与课题组的研究成果,以肝癌、胰腺癌等为例,借助课题组开发的scCancer肿瘤单细胞转录组分析软件,探讨如何在单细胞水平研究肿瘤细胞以及肿瘤微环境的异质性,敬请关注!
课程安排
专家简介
张 岩
哈尔滨工业大学生命科学与技术学院教授,计算生物学研究中心主任。中国细胞生物学会功能基因组与系统生物学分会理事,中国抗癌协会肿瘤标志专业专委会肿瘤测序与大数据专家委员会主任。研究方向涉及到临床医学数据、肿瘤生物学、发育生物学等领域的数据分析及技术平台开发。目前的科研成果包括三个部分,开发生物医学领域的数据库、高通量数据分析和建模、应用工具以及后功能基因组层面的生命过程及疾病相关的生物标记物挖掘,在精准医学时代为研究不同生理病理条件的潜在机制提供靶标。系列研究成果发表在《Nucleic Acids Research》、《Molecular Oncology》、《Development》、《Epigenomics》、《Briefings in Bioinformatics》、《Database》等杂志上。
古 槿
清华大学自动化系副教授,近年来致力于研究肿瘤组学大数据信息处理的理论与方法,在组学数据低维特征学习、肿瘤细胞状态的精准识别与命运调控等方面取得了若干成果。成果发表于NAR、Bioinformatics、GPB、Gastroenterology等生物信息学、医学领域国际顶级期刊,获得国家自然科学基金优秀青年科学基金等项目资助。
王亚俊
Illumina资深行业市场经理,从事高通测序相关工作十年。先后在上海交通大学和上海生物信息研究中心从事国产第二代DNA高通测序仪的开发、平台优化及新一代测序技术生物信息学研究;2014年加入Illumina公司,先后担任产品经理,肿瘤市场经理及应用市场经理。现任illumina资深肿瘤市场经理,主要负责临床肿瘤学,癌症研究及转化等细分市场。
李翔宇
工学博士,现为北京交通大学软件学院讲师。2013年9月至2019年7月在清华大学自动化系学习,研究方向为单细胞组学数据的计算方法学研究与应用。以第一作者提出基于网络嵌入的高效的表示学习方法SCRL(发表于 Nucleic Acids Research);在单细胞组学的数据挖掘方面,积累了丰富的经验,与香港大学医学院 Kathryn SE Cheah 课题组合作研究生长板软骨细胞分化过程的调控机制,与清华大学医学院纪家葵课题组合作研究生殖细胞发育的分子机制。2019 年 7 月入职北京交通大学后,以负责人身份承担中央高校基本科研业务费人才基金一项。
听课方式
请添加个人微信13550931509或13022388299,申请入群,届时即可获取听课链接
协办单位:Illumina
特邀支持媒体:ONCO前沿
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