临床癌症基因组学 |《自然-癌症》专题

EDITORIAL | SPOTLIGHT ON CANCER GENOMICS

社论：聚焦癌症基因组学

癌症基因组学领域在以极快的速度发展，为转化应用开创了大量的可能性。在本期中，我们很高兴推出一系列特约文章，探讨基因组学在癌症研究和肿瘤学中的作用，从目前的成果到未来的方向。

REVIEW ARTICLE | CIRCULATING TUMOR DNA AND LIQUID BIOPSY IN ONCOLOGY

综述文章：肿瘤学中的肿瘤DNA循环和液体活组织检查

评估肿瘤DNA在血液中的循环已成为了肿瘤学领域的一项重要技术。Lillian Siu和他的同事们对液体活体组织检查可能的应用进行了综述，强调临床试验设计，从而实现其临床效用。

NEWS & VIEWS | ONE SIZE DOES NOT FIT ALL FOR MUTATIONAL SIGNATURES

新闻观点：突变特征不能“一刀切”

识别和分析癌症基因组中出现的突变模式能够提供有关肿瘤发生过程的重要信息。文章讨论了一个分析体系和一个基于网页的工具，旨在协助突变特征分析，进而改善肿瘤分层效果。

CANCER IN TRANSLATION | PROSPECTING WHOLE CANCER GENOMES

转化中的癌症：勘探完整癌症基因组

泛癌症全基因组分析（Pan Cancer Analysis of Whole Genomes, PCAWG）联合会启动了一组新的研究，这组研究提供了至今为止分辨率最高的癌症基因组，扩充了我们对于驱动基因、突变特性、结构改变等方面的了解。Kreisberg、Ideker、Mills和Meric-Bernstam共同讨论了由此项目所得到的基础及转化方面的见解。

Anagnostou及团队展示了一种改良后的免疫检查点阻塞应答预测方法，这种方法可以整合肿瘤纯度、RTK基因组改变、吸烟相关突变特征以及HLA状态，得到修正后的肿瘤变异负荷量估值。

ARTICLE | IMAGING MASS CYTOMETRY AND MULTIPLATFORM GENOMICS DEFINE THE PHENOGENOMIC LANDSCAPE OF BREAST CANCER

研究文章：成像质谱流式和多平台基因组学揭示乳腺癌的表型基因组

Bodenmiller及团队将成像质谱流式与METABRIC队列得到的数据相匹配，揭示了乳腺癌在空间背景中的单细胞表型和基因组特点，并发现了乳腺癌亚型和预后之间的联系。

ANALYSIS | A PRACTICAL FRAMEWORK AND ONLINE TOOL FOR MUTATIONAL SIGNATURE ANALYSES SHOW INTERTISSUE VARIATION AND DRIVER DEPENDENCIES

分析：利用突变特征分析的实用体系和线上工具展示组织间变异和驱动依赖性

Degasperi及团队介绍了一种实用体系和一个叫做Signal的线上工具，这两者可以用于分析变异特征。他们在变异特征中找到了组织特异性变异的证据，这一发现可能会影响肿瘤分类和临床应用。

关于 Nature Cancer

《自然-癌症》呈现各项癌症研究中的重大进展，涉及临床前、转化和临床上的基础工作。本刊视角广阔，将涵盖所有的癌症研究，为癌症生物学、遗传学和基因组学提供新的见解，为诊断和疗法的开发和实现提供新的方法，也为理解癌症的全球社会性影响提供新的途径。

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