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微生物学通报

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大肠杆菌Small RNA EsrE的转录调控

宋洁侯兵兵叶江吴海珍张惠展

细菌Small RNAs(sRNA)作为转录后调控因子，在调控生物膜形成、耐药应激、营养利用等过程中发挥重要作用。该实验室前期研究发现大肠杆菌中的新型sRNA EsrE调控琥珀酸脱氢酶的表达并且影响细胞生长,并且证明EsrE的转录受控于独立的启动子。然而，EsrE转录相关的反式作用因子和调控机制尚不清晰。本研究通过双质粒报告系统筛选转录调控因子，并通过凝胶迁移实验和qRT-PCR研究方法验证转录调控因子。实验结果表明，σ因子RpoH可反式调控EsrE的转录

摘要

【背景】大肠杆菌中Small RNA EsrE调控琥珀酸脱氢酶的表达并影响细胞生长，对其调控机制的探究有利于加深EsrE对细胞生长影响的认识。

【目的】探究大肠杆菌Small RNA EsrE的转录调控机制。

【方法】通过双质粒报告系统筛选转录调控因子，并通过凝胶迁移实验(electrophoretic mobility shift assay，EMSA)和qRT-PCR研究方法验证转录调控因子。

【结果】双质粒报告系统证明RNA聚合酶亚基σ³² (RpoH)上调P_esrE，β-羟酰-ACP脱水酶(FabZ)下调P_esrE。EMSA结果和体内实验显示RpoH结合P_esrE片段，FabZ不结合P_esrE片段。

【结论】RpoH直接结合启动子序列参与调控，FabZ以其他方式间接参与Small RNA EsrE的转录调控。