以下文章来源于TBM学院 ,作者TBM学院
中国抗癌协会肿瘤标志专委会的学术培训媒介
上一篇教程介绍了 UCSC 数据库, 这一次的教程则接着介绍 UCSC xena 的在线数据分析工具
首先我们进入 ucsc xena 网站 >
https://xena.ucsc.edu/
ucsc xena 提供了多种的在线数据分析功能,其中包括
1. 生存分析
2. 癌组织和正常组织的差异基因比较
3. 基因组和患者信息关系
4. 建立基因组亚型
今天我们学习的是:
使用 ucsc xena 工具进行在线的生存分析
我们今天的教程就是直接使用 ucsc 数据库中的数据吧
然后耐心等待数据的导入……
勾选自己感兴趣的要分析的数据类型
第二属性也是同样的方法设置,设置完成后变成这样
这样生存曲线就绘制完成啦~
上述提到的 4 种分析都可以用刚刚一样的操作完成,一步到位!
【好课别错过】
肿瘤标志挖掘技术与应用体系课1-3
1. 肿瘤标志物研究的实用数据库资源(36个肿瘤数据库)
2. 常用的高通量数据及分析方法介绍(19个分析软件)
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