千呼万唤始出来 | 2018年Cancer Cell最佳文章放榜，杨达的文章唯一被入选

长的非编码RNA（长ncRNA，lncRNA）定义为长度超过200个核苷酸的转录本，不会翻译成蛋白质。这种有点任意的限制将lncRNA与小的非编码RNA区分开来，例如microRNA（miRNA），小干扰RNA（siRNA），Piwi相互作用RNA（piRNA），小核仁RNA（snoRNA）和其他短RNA。

LncRNA和PCGs在十种癌症类型中具有不同的DNA甲基化模式

最近对人类癌症转录组的全基因组表征已经证明lncRNA表达是癌症中最普遍的转录变化之一。进一步的实验证据表明lncRNA可以在肿瘤发生中起重要作用。与蛋白质编码基因（PCG）类似，lncRNA表达受到癌症起始和发展中发生的基因剂量（例如拷贝数改变）和启动子利用（例如DNA甲基化）的变化的影响。

EPIC1与MYC直接结合

表观遗传调节是用于控制lncRNA表达和组织特异性的主要机制之一。表观遗传改变已被确定为肿瘤发生的标志之一。然而，lncRNA基因的表观遗传改变及其在癌症中的后果仍未得到很好的表征。基因组规模研究已经对肿瘤中的DNA甲基化变化产生了重要的见解，但主要集中在PCG启动子上。大规模癌症基因组/表观遗传项目的出现，如癌症基因组图谱（TCGA）研究网络项目，为表征癌症中lncRNA表观遗传景观提供了极好的机会。

文章总结

研究人员重新利用并整合了来自TCGA，癌症细胞系百科全书（CCLE）和癌症体细胞突变目录（COSMIC）的多维基因组和表观遗传数据，该研究描述了对20种癌症类型中lncRNA基因的表观遗传景观的深入表征，并发现lncRNA的表达通过低甲基化在肿瘤中反复表观遗传激活。 该研究提供了鉴定具有致癌活性的lncRNA基因的整合策略。 使用该策略，鉴定并验证了EPIC1作为致癌的lncRNA。 

总之，在癌症中建立DNA甲基化改变的lncRNA的详细知识库将有助于鉴定癌症驱动的lncRNA。这些发现扩展了癌症中MYC活化的已知机制，并为通过其与EPIC1的相互作用开发靶向MYC的疗法铺平了道路。EPIC1强烈的预后相关性，EPIC1敲低强烈抑制肿瘤生长，以及EPIC1促进乳腺癌的机制的阐明将有助于基于lncRNA的乳腺癌疗法。

参考信息：

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1535610818301107?via%3Dihub

https://en.wikipedia.org/wiki/Long_non-coding_RNA

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