土壤微生物在分解作物秸秆时，需要一定的氮素，易出现与作物幼苗争夺土壤中速效氮素的现象。玉米秸秆碳氮比为65~85∶1，而适宜微生物活动的碳氮比为25∶1，秸秆还田后土壤中若氮素不足，微生物会与作物争夺氮素，麦苗就会缺氮而黄化、瘦弱，生长不良。解决方法：秸秆粉碎后，可在秸秆表面每亩撒施碳酸氢铵50千克或尿素20千克，然后再行耕翻。

秸秆粉碎后，一定要用重型圆盘耙耙两遍，以进一步切碎秸秆和根茬，耙后要及时深翻和压盖，以碎土保墒，使秸秆、肥料与土壤混合，地面无明显粉碎秸秆堆积，并分布在3-10厘米的土层中。要做到不漏翻、覆盖严密，以免养分散失。耕后要耙平，以利于播种。有的地块粉碎后的秸秆过长，长度大于10厘米，不利于耕翻，影响播种和小麦种子正常发芽出苗。

玉米秸秆还田时，一般应埋入10厘米以下的土层中，并耙平压实。同时还应注意本田秸秆还本田，不要将本田的秸秆还到其他田。秸秆还田后，由于秸秆本身吸水和微生物分解吸水，会降低土壤含水量。因此，要及时浇水，以加速土壤沉实，促使秸秆与土壤紧密接触，防止架空。

 秸秆还田数量要根据水源和耕作条件而定，原则上应保证当年还田秸秆充分腐烂，不影响下茬耕作，每亩还田秸秆以300-400公斤为宜，大量玉米秸秆还田，使土壤变得疏松和空隙增大，失墒较快，种子与土壤难以紧密接触，影响种子发芽出苗，田间出苗常不整齐，容易出现缺苗断垄现象。