《Nature》期刊是允许对 Blots 图片进行剪切的,但是剪切必须要在图注中进行说明,同时《Nature》也提到了一些期刊要求必须在文章增补信息中提供完整的 blots 图片。
裁剪后的 Blots 图必须有一定的宽度 「上下各 6 个条带的宽度」(不要过窄,以掩盖一些必要信息)。高对比度的 blots 图片是不允许的,因为这会掩盖一些附加条带信息。投稿者应尽量曝光出带有灰色背景的图片,若高对比度 blots 不可避免,也应在增补信息中提供多次曝光的图片(以说明没有掩盖其他信息)。
什么是高对比度 blots 图片?我们来看一下其他期刊高对比度 blots 的示例:
(Journal of Cell Science,Best Practices: gels, blots and images in JCS figures)
(Journal of Biological Chemistry, Good practices for preparing publication-quality figures)
(The Journal of Experimental Medicine,Gel Image Guide 2016)
对于灰度图像,每个象素用一个字节(8bit)表示,一幅图像可以有 256 级灰度;若每个象素用两个字节(16 bit)表示,一幅图像可以有 65,536 级灰度。为了保留更多实验细节,16 bit 的 TIF 图像更为常见。所以,千万不要以为某些 8 bit 数据能给您带来更好的结果体验(背景干净,条带清晰),它也许会给您带来文章被拒的风险!Journal of Cell Science 已经明确表示,这样的文章有可能会因此被拒收。
我们一起来 「学习」 一下 8 bit 的 blot 数据,看看问题出在哪里。这是一幅用 ImageJ 软件打开的 8bit 化学发光图,几乎没有背景信息(属于高对比度类型,需要调整对比度,以显示灰色背景)。
当我们调整对比度以后会发现依然有很多背景信息丢失,而且图片颗粒感很强!图片质量很差!根本无法显示成像对象的细节信息!
真正的 16 bit 数据在调整对比度后,可以显示出均一、细腻的灰色背景。我们可以发现,这原来是在 96 孔板上的化学发光信号(将二抗比例稀释后,加入 ECL 底物)。但在 8 bit 的 TIF 图片上,根本无法显示出这样的背景信息。特别是按照《Nature》要求调整出来的背景后,图片质量无法令人满意,文章有可能会被拒绝发表!
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文章来源:Bio-Rad
题图来源:站酷海洛
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