“水产生物病害与防治”专栏——鱼源致病菌皮特不动杆菌 Ap-W20 的全基因组序列及其毒力特征分析

鱼源致病菌皮特不动杆菌 Ap-W20 的全基因组序列及其毒力特征分析

王超杰¹， 黎 洁¹， 王 旭¹， 王至诚¹， 王卫民¹， 罗 毅^1,2*

1. 华中农业大学水产学院，农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室，湖北 武汉 430070；

2. 农业微生物学国家重点实验室，湖北 武汉 430070

皮特不动杆菌是一种新兴的鱼源致病菌，为了对该菌的致病机理进行研究并为该菌引起的鱼类疾病防治提供技术储备，实验选取皮特不动杆菌菌株 Ap-W20 进行了全基因组测序，并对其毒力特征进行了分析。结果发现，Ap-W20 全基因组序列总长为4 399 705 bp，GC 含量为 38.78%，共预测到 4 230 个编码序列 (CDS)，存在 4 个质粒，GenBank 数据库登录号为 CP027658~CP027662。ANI 分析结果证实，Ap-W20 属于皮特不动杆菌，且 Ap-W20 与已知人源皮特不动杆菌 AP_882(96.69%) 和环境源皮特不动杆菌 PHEA-2(96.55%)相似度较高。Ap-W20 与 AP_882、PHEA-2 的比较基因组学分析发现，Ap-W20 中的基因岛、前噬菌体和质粒数量最多，这很可能与它们各自的分离环境和致病力有关。通过与毒力因子数据库 (VFDB) 比对，在 Ap-W20 全基因组中预测到 286 个毒力基因，主要与黏附和抗吞噬等有关。Ap-W20 中还存在Ⅰ、Ⅱ和Ⅵ型分泌系统、多套双组分调控系统以及细菌素合成基因簇等，表明鱼源皮特不动杆菌可能存在复杂的致病机制。本研究对鱼源皮特不动杆菌全基因组进行了毒力特征分析，为该菌引起的鱼类疾病防治奠定了基础。

皮特不动杆菌；全基因组测序；ANI 分析；比较基因组学；毒力特征