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抗体选择错误引发学术灾难,多篇SCI经验教你识别假抗体!

科界 06月21日

来源:ZSCI

在Western  blot、IHC/ICC/IF、ELISA/FACS(表位)/Co-IP、ChIP等这些实验中,都需要用到抗体,但是抗体市场的庞杂带来了质量的参差不齐,抗体的不可靠性也会给科研带来巨大损失,包括时间和资源上的浪费。

2006年耶鲁大学病理学家David Rimm研究了一项有效治疗黑色素瘤皮肤癌的指导方法,这项技术的基础是抗体——可以结合成为特殊生物学分子的Y形大蛋白,而且可以在样本中标志它们的存在。而当他准备好资金来将这种检测推广到临床时,他的团队从同一家公司订购的新的同一批次的抗体(可以认为性质是相同的)却无法重现原始的研究成果,难以产生同样的染色模式!Rimm被迫放弃自己关于黑色素瘤抗体疗法的研究。

与其事后懊悔,研究者们还是应该投入多一点精力在抗体选择上。今天推荐几个抗体选择网站,抗体真假不用担心,一查便知!

1、CiteAb

https://www.citeab.com/

CiteAb是全球最大的抗体搜索引擎,所有产品的搜索结果严格按照文献引用数目进行排名,抗体供货商无法用付费来提升排名。目前该平台收录了来自全球的192家抗体供应商、超过400万种抗体、165+万余篇文献。

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以β-catenin为例,进行搜索:出来很多关于该抗体的信息,也包括引用文献次数最多的厂家及产品信息,大家可以根据需要自行选择。一般引用越多的产品,质量往往越有保障。

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2、Labome

http://www.labome.com

Labome集合了全球各大知名生物试剂公司抗体/ELISA、siRNA/shRNA、生化试剂等产品的第三方查询网站,相当于一款搜索引擎。主要可以解决遇到不常见的抗体时可以快速查询市面上哪些厂家有卖你想要的抗体,以及对比各家公司的抗体产品。

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进入网页以后,输入自己想找的抗体,直接点击submit进行查询。

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点击验证的抗体数据库,得到相关信息如下图:

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点击PCNA抗体,得到相关信息如下图:

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Labome也能显示厂家的名称,货号等,点击抗体名称AKT后出现该抗体的详细界面,可通过Reference搜索相关参考文献,看这个抗体在别人实验中的效果怎么样。

3、Antibody Validation Database

http://compbio.med.harvard.edu/antibodies/

Antibody Validation Database也是一个比较专业的抗体搜索引擎。

以H3K4me3为例进行检索,点击“search”,出现H3K4me3的目标种属显示多个,抗体10个,在物种“fruit fly, human, worm”中得到验证验证,其中WB验证8个,Dot blot验证8个,ChIP-chip/seq验证9个。

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4、Antibodypeida

http://www.antibodypedia.com

Antibodypedia是由人类蛋白质图谱研究项目推出的抗体在线在线门户网,已经录编了180多万种抗体并且评估了用于不同实验技术的抗体验证数据。

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① 输入蛋白名进行检索

② 选择检索类别

③ 点击search

以PCNA的WB抗体为例,点击search后如下:

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点击WB列的链接得到右图的蛋白验证图,如果点击免疫组化则会得到相应的免疫组化验证图。

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5、Biocompare

http://www.biocompare.com/

Biocompare主页面如下:在检索框输入蛋白名,PCNA为例,选择抗体,点击search,检索出来的结果非常详细。

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