自噬是一种进化上保守的降解途径,其受自噬相关(ATG)蛋白和转录因子的严格调节。鉴于自噬的细胞质靶标种类繁多,其失调与许多疾病相关,如神经退行性综合征,心血管疾病和癌症。在自噬期间,细胞质材料被隔离在自噬体内(双膜结构)并被转运至溶酶体用于消化。尽管对这些步骤中的每一步都有重要的见解,但自噬体 - 溶酶体融合的机制最不为人所知。TFEB(转录因子EB)是溶酶体生物发生的关键基因,其在自噬过程中的功能已被充分证明。先前的研究表明,翻译后修饰(PTM)如MAPK依赖性磷酸化调节TFEB的核定位和活性。然而,仍然不知道核苷酸水平的修饰是否可以控制TFEB的活性和表达以及哪种酶介导这种修饰。
H / R和I / R分别诱导心肌细胞和小鼠心脏中m6A RNA修饰水平升高
N6-甲基腺苷(m6A)修饰是真核mRNA中最普遍的内部修饰。 通常,m6A修饰包含在共有序列5'-RRACU-3'内(R = A或G;甲基化腺苷残基被强调)并且主要发生在翻译终止密码子附近的3'-UTR的开始处。虽然转录组范围的m6A分析显示m6A修饰存在于数千个具有独特分布模式的RNA转录物中,但大多数m6A RNA修饰的功能仍然未知。
在H / R处理的心肌细胞中,shMettl3增强的自噬通量需要TFEB
在哺乳动物细胞中,m6A的修饰由甲基转移酶复合物催化,该复合物含有METTL3(甲基转移酶如3),METTL14(甲基转移酶如14)和WTAP(WT1相关蛋白)。反过来,ALKBH5(alkB同源物5,RNA去甲基化酶)和FTO(FTO,α-酮戊二酸依赖性双加氧酶)作为两种哺乳动物RNA去甲基化酶起作用,以逆转m6A修饰。
ALKBH5,但不是FTO,逆转心肌细胞中TFEB mRNA的H / R介导的m6A修饰
m6A在哺乳动物中发挥多种生物学功能,如胚胎干细胞维持和分化,转录剪接,核RNA输出等。研究表明,m6A修饰与mRNA降解增加密切相关。因此,m6A修饰的调节机制的破坏可能与人类疾病有关。然而,m6A修饰的状态和人类心脏病的潜在调节机制仍未完全了解。本研究探讨了m6A修饰在缺氧/复氧(H / R)治疗的心肌细胞自噬中的作用,并探讨了m6A参与缺血性心脏病的机制。
TFEB在心肌细胞的转录后水平抑制METTL3
该研究显示在缺氧/复氧(H / R)处理的心肌细胞处理的小鼠心脏中m6A修饰增加,同时发现METTL3(甲基转移酶如3)是参与异常m6A修饰的主要因素,METTL3的过表达或RNA去甲基化酶ALKBH5的抑制具有相反的作用,表明METTL3是自噬的负调节物。
机制上,METTL3甲基化TFEB,促进RNA结合蛋白HNRNPD与TFEB前mRNA的结合,并随后降低TFEB的表达水平。进一步的实验表明,METTL3缺乏增强的自噬通量是TFEB依赖性的。反过来,TFEB以相反的方向调节METTL3和ALKBH5的表达水平:它诱导ALKBH5并抑制METTL3。 TFEB与ALKBH5启动子结合并激活其转录。相反,TFEB对METTL3的抑制不涉及转录抑制,而是涉及mRNA稳定性的下调,从而建立负反馈环。总之,该研究揭示了METTL3-ALKBH5与自噬之间的关键联系,提供了可逆mRNA m6A甲基化及其调节剂在缺血性心脏病中的功能重要性的见解。
参考信息:
https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/15548627.2019.1586246
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