Science | 再取新突破，张锋开发新型的碱基编辑器

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先前张锋等人开发了一种名为REPAIR的RNA碱基编辑技术（用于可编程A到I（G）置换的RNA编辑），通过将催化灭活的RNA靶向CRISPR-Cas13（dCas13）与ADAR2的腺嘌呤脱氨酶结构域融合，开发出可A至I RNA编辑方法。然而，REPAIR以及许多其他RNA编辑技术仅允许A到I的转换。用于精确RNA编辑胞苷至尿苷的技术将极大地扩展疾病突变和蛋白质修饰的范围。

2019年7月11日，张锋等人在Science 在线发表题为“A cytosine deaminase for programmable single-base RNA editing”的研究论文，该研究通过定向蛋白进化将ADAR2转化为胞苷脱氨酶，称为特定C到U交换的RNA编辑（RESCUE）。 RESCUE使RNA编辑可靶向的致病突变数量增加一倍，并能够调节磷酸化信号相关残基。 研究人员应用RESCUE来驱动β-catenin激活和细胞生长。 此外，RESCUE保留A到I的编辑活性，通过使用定制的指导RNA实现多重C到U和A到I的编辑。RESCUE是一种可编程的碱基编辑工具，能够在RNA中精确地进行胞苷至尿苷的转换。 总体而言，RESCUE通过新的基础编辑功能扩展了RNA靶向工具包，允许扩展建模和遗传疾病的潜在治疗。

2019年6月20日，美国博德研究所张锋等人在Cell 发表题为”DNA Microscopy: Optics-free Spatio-genetic Imaging by a Stand-Alone Chemical Reaction“的研究论文，该研究展示了DNA显微镜，这是一种独特的成像模式，可用于相对生物分子位置的可扩展，无光学映射。在转录物的DNA显微镜检查中，转录物分子用随机核苷酸原位标记，特异的标记每个分子。第二次原位反应然后扩增标记的分子，连接所得的拷贝，并添加新的随机化核苷酸以唯一地标记每个连锁事件。算法解码来自这些连锁序列的分子邻近性，并以精确的序列信息推断细胞分辨率的原始转录物的物理图像。由于其成像能力完全来自扩散分子动力学，因此DNA显微镜构成化学编码的显微镜系统（点击阅读）；

2019年6月6日，美国博德研究所张锋在Science 在线发表题为“RNA-guided DNA insertion with CRISPR-associated transposases”的研究论文，该研究表征来自蓝细菌Scytonema hofmanni的CRISPR相关转座酶（CAST），其由Tn7样转座酶亚基和V-K CRISPR效应物（Cas12k）组成。ShCAST通过在原型间隔区下游60-66bp处定向插入DNA片段，该过程是催化RNA指导的DNA转座。ShCAST将DNA整合到大肠杆菌基因组中的独特位点，频率高达80％，无需正选择。 这项工作扩展了对CRISPR-Cas系统功能多样性的理解，并建立了精确DNA插入的范例（点击阅读）。

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