北京农学院秦岭教授课题组破译中国板栗全基因组学术资讯

来源：植物科学最前沿

2019年9月13日，《Gigascience》杂志在线发表由北京农学院林木分子设计育种高精尖创新中心秦岭教授课题组研究论文：Hybrid de novo genome assembly of Chinese chestnut (Castanea mollissima)。该研究组装及注释了中国板栗基因组，是栗属植物中第一个完成基因组测序的树种。

中国板栗 (Castanea mollissima) 为壳斗科栗属植物，是我国重要的干果之一，富有“木本粮食”之称。广泛栽培于我国26个省份，年产193万公吨，约占世界栗总产量的83.34%，是我国山区栗农脱贫增收的“铁杆庄稼”。中国板栗种质资源遗传多样性丰富，品质优良，抗栗疫病，耐瘠薄，已成为栗属植物种质创新的重要亲本资源。高质量的中国板栗基因组图谱为栗属植物的起源进化、遗传改良等研究奠定了重要的基础。

该研究基于二代和三代测序获得了板栗高质量基因组序列，基因组大小为785.53 Mb，Contig N50为944 Kb，注释了36,479个基因。根据BUSCO分析，基因组完整性为96.7%。与三个近缘物种Quercus robur、Fagus sylvatica和Juglans regia的基因组相比，中国板栗具有8884个特有基因家族和11,952个特有基因。基因组进化分析表明中国板栗和Quercus robur的分化发生在1362万年前。

该研究由北京农学院林木分子设计育种高精尖创新中心联合天津生物芯片技术公司、荷兰瓦赫宁根大学、河北农科院昌黎果树研究所和中国科学院华南植物园共同完成。北京农学院植物科学技术学院邢宇教授、博士研究生刘阳、张卿高级工程师为共同第一作者，北京农学院林木分子设计育种高精尖创新中心、植物科学技术学院秦岭教授和曹庆芹教授为共同通讯作者。相关工作得到了国家重点研发计划、国家自然基金和北京市属高校高水平教师队伍建设等项目资助。

原文链接：

https://academic.oup.com/gigascience/article/8/9/giz112/5568369

来源：frontiersin 植物科学最前沿

原文链接：http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyOTY2NDYyNQ==&mid=2247492934&idx=1&sn=90e6d00149be04d41e354456941457c9&chksm=e8bd9758dfca1e4ec46ccef3afc80818ea91cb77b541a45af56a84b8c4e82b989e8bcc3ce8d8&scene=27#wechat_redirect

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