以下文章来源于iPlants ,作者潜心者
传递有趣的、有意义的植物科学研究
综述所述,动物细胞感知氧气的分子机制主要建立在HIF-1转录因子的羟基化及后续的泛素化进而降解得到平衡氧气的浓度。然而,在植物中,如遭水淹没导致氧气含量的下降,进而调控基因转录,从而促进无氧代谢,最终维持底物水平ATP的生产。那么其感应低氧浓度的机制又是如何呢?
N末端规则途径最是导致蛋白水解的一系列生化反应,因为它取决于蛋白质或肽中暴露的N末端氨基酸残基。在这两篇论文中都发现了拟南芥乙烯响应因子VII类(ERF-VII)转录因子及N端规则途径组分是作为植物氧气感应机制发挥功能。研究发现,大多数ERF-VII转录因子在倒数第二个位置(MCGGAI)具有一个由半胱氨酸残基的N末端结构域。该氨基酸序列提供了被特定的氨肽酶识别的分子标记,以去除初始的甲硫氨酸,从而使半胱氨酸暴露为N末端残基。半胱氨酸可以被植物半胱氨酸氧化酶(PCO)氧化,使用氧气作为共底物以生成亚磺酸加合物。该部分继而用作精氨酸转移酶的底物生成精氨酸。PROTEOLYSIS(PRT)蛋白可识别暴露的N末端精氨酸的存在,该蛋白是单亚基E3泛素连接酶,可将泛素单元添加到近端赖氨酸残基上。一旦多泛素化,ERF-VII蛋白就可以通过26S蛋白酶体降解(如下图)。因此,这种机制提供了一种诱导细胞中依赖氧的分子反应的有效方法:氧利用率的降低会阻止Cys2残基的氧化,从而导致ERF-VII在细胞核中积累。即有氧情况下ERF-VII转录因子会降解,而无氧的情况下ERF-VII在细胞核中积累,调控植物无氧响应。
植物中N-end rule pathway(Annu. Rev. Plant Biol. 2015. 66:345–67)
此外,两篇文章中还发现乙烯响应因子RAP2.12定位在细胞膜上。在低氧条件下,质膜定位的转录因子RAP2.12从质膜释放,由于细胞中的低氧浓度,其降解受到抑制。因此,转录因子积聚在细胞核中,并同时诱导参与厌氧代谢的基因和减弱RAP2.12活性的基因。此外,之后的研究表明,线粒体电子传输链的抑制会导致瞬时活性氧(ROS)积累,该信号通过有丝分裂原激活的蛋白激酶MPK3,MPK4和MPK6转导作为信号,从而激活参与ROS清除的基因。另外,由缺氧引起的光合活性的抑制产生未知的信号,该信号诱导涉及维持质膜完整性的基因(如下图)。
植物细胞对低氧的响应机制(Annu. Rev. Plant Biol. 2015. 66:345–67)
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