中国农大/江苏农科院创建最大玉米转座子插入资源库

科技工作者之家 2019-10-25

来源:BioArt植物

2019年10月21日,中国农业大学农学院宋任涛课题组和江苏省农科院赵涵课题组合作在Plant Physiology在线发表了题为A sequence-indexed Mutator insertional library for maize functional genomics study的研究论文。该研究报道了我国独立构建的玉米Mutator转座子突变体资源数据库(ChinaMu)。该数据库是目前世界上最大的玉米插入资源库,将成为全球玉米功能基因研究的重要资源。

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该研究利用玉米Mutator转座子活性系创制了大型转座突变体库,并结合了分子生物学、基因组学和生物信息学手段,对2,581个转座家系进行了所有转座子插入位点的分离和分析,鉴定到约97,000个可遗传的Mu插入位点。插入位点数是之前国际上最主要的Mutator插入资源库(UniformMu)的两倍。对其中66,565个高质量插入位点的分析表明,ChinaMu资源库已经覆盖了玉米20,244(45.7%)的基因,其中13,425(66.3%)个基因有两个及以上的插入。ChinaMu和已有的UniformMu联合使用,可以覆盖约52.2%的玉米基因。本研究中所得的插入位点数据,可通过网站进行查询

http://chinamu.jaas.ac.cn/Default.aspx

相应的插入突变材料的分发工作正在积极筹备中,计划年底材料将陆续对外分发。

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该论文为中国农业大学、江苏省农科院和上海大学合作完成。中国农业大学农学院研究生的梁磊和李念櫆,以及江苏省农科院种质资源与生物技术所周玲副研究员,和上海大学生命科学学院唐远平老师为该文的共同第一作者。中国农业大学农学院宋任涛教授和江苏省农科院种质资源与生物技术研究所赵涵研究员为该文的通讯作者。

论文链接:

http://www.plantphysiol.org/content/early/2019/10/21/pp.19.00894

来源:bioartplants BioArt植物

原文链接:http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU3ODY3MDM0NA==&mid=2247492756&idx=2&sn=3f15b0d864394493903f5746bf41ad45&chksm=fd737ef3ca04f7e5b476ad52acf32447e29dc07e0761be300c873414ed76003f723b76aca41c&scene=27#wechat_redirect

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