本文转载自:植物病毒与抗逆研究公众号,介绍植物病理学与植物抗逆研究的新进展,相关领域的朋友可关注
近日,Plant Physiology在线发表了题为“ Gcorn plant: a database for retrieving functional and evolutionary traits of plant genes ”的研究论文,公布了一个超级酷的数据库,只需要输入基因名字,一步即可获得绝大多数植物中的同源基因。
该研究团队设计了Gcorn plant数据库,用于检索感兴趣的植物基因的同源性和进化信息。其中共包括62种陆生植物和11种绿藻,共含有2682261个序列。为了显示目的基因的功能和进化特征,该数据库直接给出具有高同源性指数的基因的系统发育树,以及具有各种同源性指数的基因数目的折线图。
下面就举例看一下这个数据库是有多么的友好:
1. 打开网址,输入感兴趣的基因的名字,选择自己感兴趣的物种。
2. 点击提交后会出现基因列表,找到自己需要的基因,点击Go
3. 点击Go后会直接出现下面所有数据
注意:是可以一键导出上面所有基因的氨基酸序列
所有基因都提供链接,直接链接到NCBI数据库,还有更多功能均可以试试。
网址:
http://www.plant.osakafu-u.ac.jp/~kagiana/gcorn/p/
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