Cell综述｜朱健康院士综述植物非生物胁迫信号转导（全文翻译，值得收藏）

iPlants公众号：作为固定的生物,植物必须适应土壤盐碱害、干旱以及极端温度等非生物胁迫。植物主要胁迫信号途径与酵母SNF1激酶和哺乳动物AMPK激酶有关,显示这些途径可能由能量感知途径进化而来。胁迫信号通过调控离子和水的运输,代谢和转录重组过程中的关键蛋白以维持胁迫条件下离子和水的动态平衡,保持细胞的稳定。对非生物胁迫的信号传递和应答过程的深入了解将有助于提高作物的逆境适应能力,实现农业的可持续发展,并保障日益增长的世界人口的粮食安全。2016年10月，中科院上海植物逆境生物学研究泰斗朱健康院士在Cell杂志上发表了题为“Abiotic stress signaling and responeses in plants”的综述。该文由中国水稻研究所倪建平翻译该文，发表在《中国稻米杂志》上，我们全文附上，以飨读者。

       植物需要应对持续变化的环境,包括经常性的不利于植物生长和发育的胁迫环境。这些不良环境包括生物胁迫(如病原体感染和食草动物的啃食)和非生物胁迫(例如干旱、高温、冷害、营养匮乏、盐害以及土壤中铝、砷、镉等有毒金属毒害)。干旱、盐害以及温度胁迫是影响植物的地理分布、限制农作物产量,并威胁粮食安全的主要环境因子。极端天气越来越频繁的出现,将加剧非生物胁迫对农业生产的不利影响(Fedoroff et al,2010)。植物如何感受和响应环境胁迫是一个根本性的生物学问题。另外,提高植物抗逆性对农业生产和环境的可持续性也至关重要,因为低抗逆作物需要消耗更多的水和肥料,极大增加环境负担。

区分缺水和高盐导致的初级胁迫信号和次级胁迫信号,对于理解干旱胁迫和盐胁迫来说非常重要。干旱造成的初级胁迫信号是高渗透压胁迫,通常被简称为渗透胁迫。这是由于典型的低渗透压条件对植物细胞来说并不是问题。盐胁迫同时对细胞造成渗透胁迫和离子毒害。干旱胁迫和盐胁迫的次级影响较复杂,包括导致氧化胁迫、破坏膜脂、蛋白质和核酸等细胞组分,并引起代谢紊乱。因此,一些细胞应答来自初级胁迫信号,而另外一些主要来自次级信号。干旱胁迫和盐胁迫有各自独立和一些共同的信号转导机制。干旱和盐胁迫的一个重要特征是渗透胁迫信号能够引起植物激素脱落酸(ABA)的累积,进而引起植物的适应性反应(Zhu,2002)。

本文综述了已知的胁迫信号感受器,以及细胞器在胁迫感受和应答中的作用;同时也概述了离子胁迫、渗透胁迫、ABA和温度胁迫相关信号途径的最新进展。本文将重点介绍SNF1/AMPK相关蛋白激酶以及其他激酶是如何被激活,以及这些激酶如何应答上游信号感受机制,并调控基因表达、新陈代谢、生理、生长及发育等下游过程。

1 胁迫信号感知及潜在的感受器

不同的环境胁迫会引起植物在基因表达、代谢和生理性状等方面的特异的反应。因此可以推测,植物细胞能够感知不同的环境信号。尽管科学家做出了诸多努力,目前也只发现了少数几个胁迫感受器。感受蛋白的功能冗余,即一个感受蛋白的缺失并不导致胁迫应答的显著变化,可能是科学家面临的主要困难。另外一种情形是,某个感受器可能是植物生长必需的,而功能缺失突变体将不会存活,致使无法对其深入研究。此外,很难从技术上证明一种蛋白质或其他大分子是物理信号(如渗透压的变化、离子浓度或温度)的感受器。这导致即使对于一些被广泛承认的细菌、酵母或者哺乳动物的渗透或温度受体,也缺乏这些受体直接感受渗透或温度等物理信号的实验证据。

拟南芥OSCA1(reduced hyperosmolality-induced calcium increase 1)被认为是一个渗透胁迫的感受器(Yuan et al.,2014)。研究者利用水母发光蛋白(Aequorin)或其他钙因子检测发现,高盐、冷害、热害导致的渗透胁迫以及氧化胁迫、重金属和ABA处理会导致植物细胞质自由钙离子浓度增加。相对于野生型,osca1功能缺失突变体在山梨醇和甘露醇处理下钙离子释放减少(Yuan et al.,2014)。OSCA1基因编码一种质膜定位的渗透压控制的钙离子通道。由于突变体植株并无干旱胁迫或者盐胁迫相关的表型,OSCA1对于渗透胁迫的重要性尚存疑问。我们不清楚OSCA1如何感知渗透胁迫,推测可能是通过减少细胞膨胀,影响膜牵张以及质膜和细胞壁的相互作用。在非植物体系中,许多机械敏感通道,包括TRP、Msc S-like、Piezo、DEG/ENa C以及K2P已被发现(A'rnadóttir and Chalfie,2010;Hedrich,2012)。动物TRP通道是众所周知的钙通道,可以感知温度或渗透压波动引起的膜变化('Аrnadóttir and Chalfie,2010)。植物基因组中缺乏TRP和DEG/ENa C基因,但含有一个Msc S-like蛋白家族和一个Piezo同源体(Hedrich,2012)。一个拟南芥Msc S-like蛋白MSL8,是花粉在缺水渗透胁迫下生存所必需的,研究表明,MSL8是低渗胁迫诱发的膜张力变化的感受器(Hamilton et al.,2015)。植物也有一个大的环核苷酸门控离子通道(CNGCs)家族以及类谷氨酸受体(GLR)家族,可能对于调控胁迫应答的胞质Ca2+信号具有重要作用(Swarbreck et al.,2013)。

最近报道的调控水稻冷胁迫感知的COLD1是另一个潜在的胁迫感受器。COLD1对于水稻亚种日本晴抵抗冷害(0~15℃)是必需的(Ma et al.,2015)。COLD1是一种细胞膜和ER的跨膜蛋白。COLD1与植物中α-异源三聚体G蛋白的RGA1亚基相互作用。作者推测,COLD1能调节钙通道或者其本身就是一个冷激活钙通道(Ma et al.,2015)。目前尚不清楚COLD1如何调控钙信号并增强抗冷能力。

冷和热都能影响细胞膜磷脂双分子层的流动性(Sangwan et al.,2002)。这种变化可能被一些整合膜蛋白,包括通道和各种其他转运体以及膜锚定受体激酶(RLKs)所感知。高温胁迫下热变性引起蛋白的错误折叠也可能被与其结合的分子伴侣所感知(Scharf et al.,2012)。与错误折叠蛋白的结合使热胁迫转录因子从与分子伴侣结合态中释放,并激活热敏基因的表达。最近,H2A.Z-核小体被认为是植物和酵母高温感受体(Kumar and Wigge,2010)。作者认为,H2A.Z-核小体包装DNA比H2A-核小体包装的DNA更加致密,温度导致H2A.Z-核小体解离,使DNA更容易被Pol II转录,从而促进热激蛋白(HSPs)及其他基因的表达。这是一个非常有吸引力的假设,但仍需要进一步验证。

2 细胞器胁迫应答

图1 不同细胞器中胁迫的感受和信号转导 

(A)细胞器分散感受胁迫的模型。胁迫引起不同细胞器功能紊乱,产生并整合信号调控核基因表达和其他细胞活动,以恢复细胞稳态。(B)内质网胁迫的感受和信号转导。(C)叶绿体胁迫的感知和信号转导。虚线表示可能的调控

胁迫感知经常被用来与配体的感知相比较,它被认为通常发生在细胞表面或细胞膜上。然后,信号会传递到不同的亚细胞位置如细胞核。从理论上讲,物理胁迫特别是温度信号,可以在细胞的任何地方被感知,只要胁迫信号能导致细胞组分的状态发生改变(蛋白质、DNA、RNA、碳水化合物或脂肪)或区域化(如,代谢反应的区域化),只要这些改变能够影响其他细胞组分或活性。胁迫导致的内质网(ER)应激蛋白质折叠的变化,称为内质网胁迫,目前已被广泛认为是一个重要的细胞胁迫应答方式。同样,胁迫也与叶绿体、线粒体、过氧化物酶体、细胞核、细胞壁等细胞器有关,从所有细胞器产生的胁迫信号,被整合后调控逆境相关基因的表达及其他细胞活性,从而恢复细胞稳态(图1)。

3 内质网(ER)胁迫

生物和非生物胁迫都会引起蛋白质错误折叠或者未折叠蛋白质的积累,这能被内质网膜上由特定的受体蛋白所感受并产生内质网胁迫。通过PKR类似的ER el F2a激酶,内质网胁迫会导致一些编码分子伴侣以及与增强蛋白折叠能力、调控ER相关降解(ERAD)或抑制蛋白质翻译相关基因的表达,从而降低加载到ER上的新合成蛋白质的总量(Walter and Ron,2011)。这些变化帮助恢复ER内的稳态,即蛋白质折叠的需求和折叠能力之间的平衡,被称为未折叠蛋白反应(UPR)。UPR是真核生物的一个保守的胁迫反应(Walter and Ron,2011)。植物中两类主要的ER胁迫受体已被确定:ER膜相关转录因子和一个RNA剪接因子(Liu and Howell,2016)(图1 B)。在ER中,亮氨酸拉链结构b ZIP28可能通过与分子伴侣蛋白BIP(binding immunoglobulin protein)互作来感知热信号和其他ER胁迫信号。未折叠或错误折叠的蛋白质在胁迫过程中积累并与BIP作用,从而使b ZIP28从与BIP的结合状态释放出来并向高尔基体转运。

在高尔基体中,b ZIP28被降解。b ZIP28的胞质部分则重新定位到细胞核,激活胁迫相关基因的表达并重建ER动态平衡。b ZIP28也可以感知能量水平和氧化还原状态的改变,或与BIP以及包含DNAJ功能域的分子伴侣的相互作用等,致使其与BIP分离(Liu and Howell,2016)。盐胁迫也以类似的方式激活b ZIP17。此外,一些ER或者质膜相关NAC转录因子可以被ER胁迫激活并参与UPR(Liu and Howell,2016)。植物第二种类型的ER胁迫感知器是IRE1,一种从酵母到后生动物保守的剪接因子。据推测,植物IRE1蛋白质以类似酵母中同源蛋白类似的方式结合未折叠蛋白并感知ER胁迫。拟南芥中激活的IRE1蛋白识别并剪接b ZIP60和其他靶m RNAs。被剪接后的b ZIP60会产生一个b ZIP60变体,从而进入细胞核激活UPR基因的表达(Liu and Howell,2016)。

4 叶绿体胁迫应答

叶绿体是光合电子传递和许多代谢反应发生的细胞器,叶绿体的代谢平衡很容易被环境胁迫影响。叶绿体稳态的紊乱可以通过逆向(retrograde)信号传递到细胞核,以协调细胞活性,使其与叶绿体胁迫程度一致,调控糖和其他化合物的供应(图1C)。叶绿体是产生超氧阴离子、过氧化氢、羟基自由基和单线态氧等ROS的主要场所(Mignolet-Spruyt et al.,2016)。各种环境胁迫,特别是高光强会促使ROS产生,严重影响ROS控制系统,产生一系列的次级信号分子。

单线态氧触发一个需要核基因编码的定位于类囊体膜上的EXECUTER(EX1)和EX2两个蛋白参与的信号途径(Wagner et al.,2004)。由于叶绿素前体原叶绿素酸脂的积累,拟南芥flu突变体在由黑到亮转化过程中会产生单线态氧的猝发。单线态氧的积累引发核基因表达剧烈变化,导致野生型植株出现缺绿表型和细胞死亡,而ex突变体不死亡(Wagner et al.,2004)。EX1和EX2是否直接感知单线态氧,以及它们如何将单线态氧信号传递到细胞核,都需要进一步研究。单线态氧引发信号也可以不依赖于EX1和EX2,推测与β-胡萝卜素非酶促氧化分解有关(Ramel et al.,2012)。

高光强和其他胁迫能够导致质体代谢物甲基赤藓醇环焦磷酸(MEc PP)含量的增加,MEc PP是一种类异戊二烯前体。MEc PP作为一个逆向信号,激活编码质体蛋白质的逆境应答核基因的表达(Xiao et al,2012)。另一个对应激反应非常重要的质体代谢物是磷酸核苷3'-磷酸腺苷5'-磷酸盐(PAP)。在干旱和高光强条件下PAP的含量增加(Estavillo et al,2011)。SAL1/FRY1是双功能磷酸酶,可以使肌醇磷脂和PAP去磷酸化(转变为AMP)。SAL1/FRY1的功能缺失导致体内PAP的积累。PAP抑制5'-3'-核糖核酸外切酶的活性,有助于增加一类干旱和高光强应答基因的表达,从而改变抗旱性(Estavillo et al.,2011)。除了PAP和MEc PP,其他叶绿体代谢物,如四吡咯(Noren et al.,2016)和β-胡萝卜素氧化分解产物(Ramel etal.,2012)也被认为可以作为逆向信号。胁迫信号是如何影响MEc PP、PAP、四吡咯含量以及其他逆向信号产物的水平尚不清楚。

5 线粒体和过氧化物酶体的胁迫应答

与叶绿体类似,线粒体和过氧化物酶体可以产生一些对胁迫应答很重要的逆向信号。线粒体和过氧化物酶体可产生ROS和许多代谢物,其中一些可能作为逆向信号分子(Ng et al.,2014)。线粒体DEXH框RNA解旋酶或线粒体PPR(pentatricopeptide repeat protein)蛋白的突变导致ROS积累,会改变植物对逆境激素ABA的反应(He et al.,2012)。线粒体复合体I的突变也导致ROS积累,并降低突变植株冷应答基因的表达,使突变体对冷害和冻害敏感(Lee et al.,2002)。CHY1基因编码一个过氧化物酶体β-羟异丁酰(HI-BYL)辅酶A水解酶,是缬氨酸分解代谢和脂肪酸β-氧化所必需的。CHY1基因的突变也能够导致ROS积累,降低冷害相关基因的表达,从而降低植物耐寒性(Dong et al.,2009)。线粒体和过氧化物酶体产生的ROS信号可能通过影响钙信号调节冷胁迫应答。

6 细胞壁胁迫应答

在植物体中,初级细胞壁是由纤维素微纤丝与木葡聚糖和阿糖基木聚糖等半纤维素相互联结并嵌入在果胶胶体组合而成(Tenhaken,2014)。细胞壁还含有酚醛树脂、过氧化物酶、果胶酯酶以及其他酶类;伸展蛋白,扩张蛋白以及其他蛋白质和Ca2+离子。盐害、干旱胁迫以及其他渗透胁迫导致ROS积累以及细胞壁的变化(Tenhaken,2014)。ROS的积累会引起酚醛树脂和细胞壁伸展蛋白等糖蛋白的交联,最终导致细胞壁硬化。另一方面,胁迫可增加扩张蛋白和木葡聚糖修饰酶基因的表达,从而重塑细胞壁(Tenhaken,2014)。盐胁迫还能够导致细胞壁Ca2+的损失。最近,细胞壁胁迫被认为可引起与真菌细胞-细胞壁整合(CWI)途径类似的专一的信号途径(Voxeur and Ho¨fte,2016;Jendretzki et al.,2011)。在酵母中,细胞壁应激反应主要是由细胞壁结合的质膜蛋白Wsc1-3、Mid2和Mtl1感知(Jendretzki et al.,2011),但这些感受器怎样检测到细胞壁变形尚不清楚。因为这些蛋白质都含有一个大的富含丝氨酸和苏氨酸残基的O-糖基化胞外结构域,推测这些蛋白质可能有牵张受体的功能。这些感受器的下游依次是GDP/GTP交换因子、小GTP蛋白Rho1、蛋白激酶C和MAPK级联途径(Jendretzki et al.,2011)。但具体的植物细胞壁胁迫感受器尚未被鉴定。植物有上百个RLKs和其他包含胞外区域、跨膜区和一个胞质激酶域的蛋白激酶,其中一些可能感受细胞壁的变化。

细胞壁变化极大地影响植物抗逆性。在拟南芥sos6(盐超敏感6)突变体中,果胶生物合成酶At CSLD5的功能紊乱,引起细胞壁发生微妙的缺陷,导致氧化胁迫,并显著增加突变体对渗透胁迫、盐和干旱胁迫的敏感性(Zhu et al.,2010)。最近,Endler等(2015)鉴定出纤维素合成酶复合体中的两种蛋白质,能帮助复合体与微管连接,对盐胁迫下植物的生长很重要(Endler et al.,2015)。胁迫条件下植物细胞壁的生理和化学变化,以及这些变化如何被植物感知,信号如何被传导,以及CWI的输出等仍有待研究。

7 离子胁迫信号

土壤盐害影响了相当比例的耕地,是限制全球农业生产的一个主要因素。高盐浓度会导致离子毒性(主要是Na+)、高渗胁迫以及如氧化损伤等次级胁迫(Zhu,2002)。目前还不清楚植物细胞如何感受Na+。在酵母Saccharomyces cerevisiae中,钙调磷酸酶途径在Na+胁迫信号的感受和耐受中起着重要作用(Thewes,2014)。Na+胁迫引起的胞质钙与EF钙结合-钙调蛋白和B亚基钙调磷酸酶(Cn B)结合。Ca2+-Cn B和Ca2+-钙调蛋白激活钙调磷酸酶的磷酸酶催化亚基Cn A。活化的钙调磷酸酶去磷酸化锌指转录因子CRZ1并使其转移到细胞核中激活ENA1和其他目的基因的表达。ENA1编码Na+-ATPase,将有毒的Na+泵出细胞,使细胞恢复离子动态平衡。植物基因组不编码任何钙调磷酸酶蛋白,即使类钙调磷酸酶(CBL)已经被广泛地用来指代植物EF钙结合蛋白家族(Yu et al.,2014)。植物运用一个被称作SOS途径的钙依赖蛋白激酶途径介导盐胁迫信号和Na+的耐受性(Zhu,2002)(图2)。在这个途径中,EF钙结合蛋白SOS3感应盐胁迫介导的胞质钙信号,SOS3与丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶SOS2相互作用并激活SOS2。SOS3主要在根中表达,SOS3的旁系同源蛋白SCa BP8/CBL10则主要在地上部表达,与SOS3的功能类似(Quan et al.,2007)。激活的SOS2磷酸化并激活质膜Na+/H+转运体SOS1(Zhu,2002)。

SOS1在根表皮细胞和木薄壁组织细胞中表达,激活的SOS1使Na+排出到土壤溶液中,以及装载Na+进入木质部中进行长距离运输,通过蒸腾流一直运输到叶片中(Shi et al.,2002;Zhu et al.,2016)。SOS1在Na+长距离运输中扮演的角色并不完全清楚,因为SOS1也在叶片木质部薄壁组织细胞中表达且功能尚不明确。也许在叶片木质部薄壁组织中有一个类似凯氏带的结构,阻止木质部液流直接进入植物叶肉细胞的质外空间。总之,SOS1可能使Na+从木质部薄壁组织中排出到叶肉细胞的质外空间。基于这一模型的一个预测是SOS1可能优先集中于叶肉细胞临近质外空间的一侧。HKT1是另一个重要的转运体,在长距离Na+运输中起着主要作用(Ma¨ser et al.,2002)。在拟南芥中HKT1是Na+主要输入者,在植株木质部薄壁组织细胞和脉管系统中的其他细胞中表达(Ma¨ser et al.,2002)。在根部,HKT1可能卸载木质部中的Na+,限制蒸腾流中的Na+总量。在叶片中HKT1装载Na+到韧皮部中再循环回根部。任何一个SOS基因功能紊乱,包括SOS1,会显著增加突变植物对盐胁迫的敏感性(Zhu.,2000)。实际上正是由于这些突变体对盐害敏感的表型,SOS基因才被发现(Zhu.,2000)。HKT1基因突变材料会增加蒸腾植物的盐胁迫敏感性,但会抑制维持最小蒸腾量的生长在培养基上的SOS突变体的盐敏感性(Rus et al.,2004)。SOS1和HKT1拮抗作用如何被协调是盐胁迫研究中的一个重要的问题。目前尚不清楚SOS1和HKT1是否在维管系统的同一细胞中表达。总之,SOS1似乎促进Na+从根到叶的运输,然而HKT1似乎限制这一过程。这两种转运体在Na+长距离运输中的重要性可能取决于盐胁迫的程度。在温和的盐胁迫下,植物激活木薄壁组织细胞SOS1对于本身有利,因为可以转移更多Na+到叶片中,存储在叶肉细胞中的大液泡内参与细胞渗透调节,促进植物生长。在严重盐胁迫下,过量Na+传输到叶片中将超出叶片本身的承载容量,因此必须卸载根部木质部中的Na+,并将叶片中Na+重新富集到根部。

图2 Ca2+-CBL-CIPK模块介导不同的离子胁迫 

高Na+,低K+,过量Mg2+和高p H(低H+)条件产生胞质Ca2+信号,Ca2+信号会激活SOS3(CBL4)/SCa BP8(CBL10)-SOS2(CIPK24),CBL1/9-CIPK23,CBL2/3-CIPK3/9/23/26以及SCa BP1(CBL2)-PKS5/24(CIPK11/14),分别磷酸化并调节SOS1(Na+/H+逆向转运)、AKT1(K+通道)、潜在的Mg2+转运体以及H+-ATPase的活性。同时图中还显示了SCa BP8通过磷酸化调节SOS1和SOS2的活性,ABI2和14-3-3对SOS2的抑制作用。箭头表示激活,短横线代表抑制作用。

几个SOS3类似的钙结合蛋白能被与其结合的类SOS2的蛋白激酶磷酸化。磷酸化对于钙结合蛋白激酶的激活很重要(Du et al.,2011)。在静止状态或无胁迫条件下,SOS2结合14-3-3蛋白,以确保SOS2处于非激活状态(Zhou et al.,2014)。此外,SOS2与磷酸酶2C类的蛋白磷酸酶ABI2相互作用,也使SOS2处于非激活状态(Ohta et al.,2003)。

SOS途径是植物中建立的第一个非生物胁迫信号途径(Zhu,2000)。核心信号组分SOS2代表了一个大的蛋白激酶家族,这些蛋白激酶的催化区域与酵母蔗糖非发酵蛋白激酶SNF1以及和哺乳动物AMP激活的蛋白激酶(AMPK)相似。在拟南芥中,这些蛋白质通常称为SNF1相关激酶(Sn RKs)。Sn RKs包括3个亚家族,其中亚家族1(Sn RK1s)中有3个成员,亚家族2(Sn RK2s)中有10个成员,亚家族3(Sn RK3s)中有25个成员(Hrabak et al.,2003)。Sn RK3s(也被称作PKSs或CIPKs)亚家族中的任一成员都能和10个类SOS3钙结合蛋白(SCa BPs,也被称作CBLs)中的一个或多个成员相互作用(Guo et al,2001)。这种相互作用是由激酶的N末端的FISL基序介导的(Guo et al,2001)。FISL基序或整个调节区域的缺失会导致激酶的持续性激活(Guo et al,2001)。大量SCa BP/CBL-PKS/CIPK的可能组合表明,Ca2+-SOS3-SOS2信号途径在植物中被广泛使用。事实上,CBL-CIPK模块在钙作为第二信使,尤其是调控离子转运蛋白活性的各种非生物信号的信号转导途径中有重要作用(图2)。例如低钾胁迫可能触发胞质钙信号,通过CBL1和CBL9激活CIPK23,磷酸化并激活钾通道AKT1(Xu et al,2006)。SCa BP1激活PKS5/CIPK11以及PKS24/CIPK14,继而磷酸化并抑制质膜上H+-ATPase活性。这种抑制作用对于细胞p H值的调节非常重要(Fuglsang et al,2007)。CBL2和CBL3与蛋白CIPK3/9/23/26相互作用,调节液泡中的Mg2+含量,对高浓度Mg2+胁迫的耐受有重要意义(Tang et al,2015)。其他已知的CBL-CIPK组合调节不同的转运蛋白,对植物响应硝酸盐、脱落酸和其他非生物胁迫逆境具有重要作用(Yu et al,2014)。

8 渗透胁迫信号转导

植物MAP激酶途径组分家族成员较多,可以组合形成上千种不同的MAP激酶模块。例如,拟南芥含有60多个MAP三联激酶(MAP3K)、10个MAP二联激酶(MAP2K)和20个MAP激酶(MAPK)(de Zelicourt et al,2016)。很久以来,在植物应对生物和非生物胁迫,如盐、干旱、寒冷、炎热和受伤以及应对生长和发育信号过程中观察到多个MAPKs,主要是MPK3、4和6的快速激活(de Zelicourt et al,2016)。在非生物逆境下,MAPK信号途径研究的困难源于上游感受蛋白的鉴别,以及决定MAPK激活的MAP3Ks和MAP2Ks的发现,还有如何将激酶的激活与下游效应蛋白和生理输出联系起来。目前还不清楚植物是否存在与酵母高渗透性甘油MAPK途径类似的介导渗透调节的MAPK级联途径(Hohmann,2002)。也许MAPK的激活主要依赖于盐和干旱胁迫引起的次级信号,而不是初级的渗透调节信号。

盐、干旱和渗透胁迫也可迅速激活Sn RK2家族蛋白激酶。在拟南芥中,除Sn RK2.9之外的所有10个Sn RK2s都能被渗透调节激活,而Sn RK2.2/3/6/7/8则被ABA激活(Boudsocq et al,2004)。尽管ABA激活Sn RK2s的分子机制已被阐明(参见下文),但渗透胁迫如何激活Sn RK2激酶尚不清楚。遗传学证据表明,渗透胁迫的耐受依赖于Sn RK2s,缺失所有10个Sn RK2s的拟南芥十突变体对于渗透胁迫引起的生长抑制超敏感(Fujii et al,2011)。snrk2十突变体植物中大量渗透胁迫应答基因的表达,脱落酸、渗透调节物质脯氨酸以及第二信使IP3积累受到影响,但是渗透胁迫诱导的ROS的积累并不受影响。这些结果表明,Sn RK2激活位于ABA积累的上游,并控制渗透调节和其他渗透胁迫的适应性反应(图3)。未来的努力应集中于寻找渗透胁迫条件下对于Sn RK2激活有重要作用的上游组分,以及鉴定渗透胁迫激活的Sn RK2s的底物蛋白。因为渗透胁迫会诱导胞质的钙信号且钙通道OSCA1也是潜在的渗透传感器(Yuan et al,2014),Sn RK2s上游的候选组分可能有包括钙调节的蛋白激酶如CPKs和SCa BP/CBL-PKS/CIPKs(图3)。在Physcomitrella patens中,最近的研究显示,类Raf激酶对于渗透压和ABA处理下Sn RK2的激活至关重要(Saruhashi et al,2015)。探寻高等植物是否有相似的蛋白激酶以及这些蛋白激酶如何整合渗透胁迫和ABA信号,将是一个非常有趣的课题。

图3 渗透胁迫和ABA感受和信号转导 

Ca2+通道OSCA1可能参与渗透信号的感受。由此产生的Ca2+信号可能激活CPKs和CBLs-CIPKs,最终使Sn RK2s被激活,进而导致ABA积累。ABA结合PYLs,与A类型的PP2Cs结合并抑制PP2Cs,导致Sn RK2.2/3/6/7/8被激活。激活的Sn RK2s使效应蛋白包括TFs(转录因子),SLAC1和Rboh D/F磷酸化。Rboh D/F生成H2O2,然后通过GHR1引发Ca2+信号。Ca2+信号激活CPKs和CBLs-CIPKs。同样磷酸化效应蛋白如SLAC1。除了Ca2+,ABA也能够诱导第二信使NO(一氧化氮)和PA(磷脂酸)以及其它磷脂信号分子。NO抑制Sn RK2s和PYLs,PA调节Rbohs蛋白活性。图中也描述了ABA激活的MAPK途径。箭头表示激活,短横线表明抑制,虚线表示可能的调节。

渗透胁迫和温度胁迫引起各种脂质信号的形成,包括磷脂酸、磷酸肌醇、鞘脂类、溶血磷脂、氧化脂类,N-酰基乙醇胺等(Hou et al,2016)。对于胁迫是如何调节产生脂质信号的合成酶的活性尚不清楚。一般来说,脂质分子与信号蛋白结合并影响后者的活性和膜定位。

9 脱落酸信号转导

脱落酸信号转导途径是植物中干旱胁迫和盐胁迫的核心(Zhu,2002)。过去十年胁迫信号的研究中,最重要的一个进展就是ABA受体的鉴别以及ABA核心信号转导途径的发现。化学遗传学和蛋白互作研究鉴定出可溶、包含START结构域的PYR/PYL/RCAR(以下称为PYL)蛋白家族是ABA的受体(Park et al,2009;Ma et al,2009)。PYL通过微摩尔级别的KD结合A-BA,当A类型的PP2Cs如ABI1、ABI2、HAB1和PP2CA存在时,PYL与ABA的亲和力可以增加近100倍。因此A类型的PP2Cs可被认为是ABA的共受体(Ma et al,2009)。当没有ABA时,PP2Cs与Sn RK2激酶包括Sn RK2.2、Sn RK2.3和Sn RK2.6(又名OST1)结合,通过与去磷酸活化环并覆盖催化中心使激酶处于失活状态(Soon et al,2012)。ABA进入PYL的中央疏水区域,诱导疏水区域处于关闭状态,并创建一个PP2Cs结合表面(Melcher et al,2009)。在PYL-ABA-PP2C复合物的里面,PP2C中一个色氨酸残基插入到ABA结合区域,将ABA锁定在该区域,复合物中PP2C的蛋白磷酸酶活性被ABA-PYL复合体所抑制(Park et al,2009)。ABA-PYL对PP2Cs的结合和抑制导致Sn RK2s从PP2Cs的结合中释放出来。释放的Sn RK2s通过自身磷酸化激活,并磷酸化许多下游的效应蛋白(Fujii et al,2009)(图3)。小G蛋白ROP11与ABI1相互作用并保护ABI1使其避免被PYL9抑制(Li et al,2012)。反之,ABI1和其他PP2Cs保护三磷酸鸟苷交换因子Rop GEF1,避免遭受ABA诱导的降解,从而形成一个Rop GEF-ROP-PP2C控制回路,在没有胁迫的条件下消除单体PYL可能导致的ABA信号的部分泄漏(Li et al,2016)。

拟南芥PYLs家族成员间存在功能冗余,尽管每个PYL可能拥有独特的生化性质和表达模式。PYL8缺失导致胁迫后恢复过程中突变体的侧根的生长对ABA不敏感(Zhao et al.,2014)。PYL8调节侧根生长的过程不依赖于ABA核心信号途径,而是由PYL8直接作用于MYB77,ABA介导的PYL8与MYB77的互作增强MYB77介导的生长素应答基因的转录(Zhao et al.,2014)。同样,PYL6与JA应答的关键转录因子MYC2相互作用,连接ABA和JA信号途径(Aleman et al.,2016)。大多数其他PYLs单基因突变体并没有显著的ABA表型。与其相反,pyr1prl1ply2pyl4四突变体植株在发芽和幼苗生长阶段对ABA不敏感(Park et al.,2009),pyr1pyl1pyl2prl4ply5pyl8突变体表现出种子萌发、幼苗生长以及气孔关闭过程中对ABA更强的耐受性(Gonzalez-Guzman et al.,2012)。

ABA强烈激活Sn RK2.2、Sn RK2.3和Sn RK2.6/OST1,也能微弱地激活Sn RK2.7和Sn RK2.8(Boudsocq et al.,2004)。拟南芥snrk2.2/3/6三突变体表现出在种子萌发、幼苗生长、气孔关闭、基因调控等方面对ABA极不敏感(Fujii and Zhu,2009)。许多响应ABA的效应蛋白是Sn RK2激酶的直接底物。b ZIP家族转录因子如ABI5和ABFs(ABA响应元件结合因子)能被Sn RK2s磷酸化(Furihata et al.,2006)。大部分发生在细胞质膜的ABA信号过程可能由与PYL相互作用的C2结构域蛋白介导(Rodriguez et al.,2014)。质膜蛋白质如阴离子通道SLAC1是Sn RK2的底物。SLAC调控干旱胁迫下ABA介导的气孔关闭以减少水分的蒸腾损失(Geiger et al.,2009)。最近磷酸化蛋白组学研究鉴定了数十个新的Sn RK2的底物蛋白,包括一些调控叶绿体功能、开花时间、mi RNA和染色质调节、RNA拼接过程相关的重要蛋白质(Wang et al,2013)。PYL-PP2C-Sn RK2核心ABA信号途径激活也可以与一个由MAP3Ks MAP3K17/18、MAP2K MKK3以及MAPKs MPK1/2/7/14组成的MAPK级联相关,后者也可能磷酸化许多ABA的效应蛋白(de Zelicourt et al.,2016)。

ABA激活的Sn RK2s也可以使质膜NADPH氧化酶Rboh F磷酸化,在质外体空间产生O2-。O2-随后形成H2O2,作为信号分子调节包括气孔关闭在内的各种A-BA应答过程(Sirichandra et al.,2009)。在拟南芥pip2;1突变体中,ABA诱导保卫细胞ROS产生减弱,表明共质体H2O2可以通过水通道蛋白PIP2;1进入细胞(Grondin et al.,2015)。MAP激酶MPK9和MPK12在保卫细胞阴离子通道调控中功能冗余,可能在ROS下游参与ABA介导的气孔关闭(Jammes et al.,2009)。另一个连接ABA信号和ROS的重要组件是质膜类受体蛋白激酶GHR1(Hua et al.,2012)(图3)。GHR1与SLAC1互作并激活SLAC1,GHR1对ABA和ROS调节的气孔关闭至关重要。有趣的是,GHR1功能被ABI2拮抗,但不受ABI1的影响(Hua et al.,2012)。H2O2也可以调节钙信号从而影响ABA的应答,H2O2活化质膜钙离子通道也需要GHR1的介导(Hua et al.,2012)。钙信号对ABA调节气孔关闭至关重要,ABA不能诱导缺失CPK5、CPK6、CPK11、CPK23四个功能冗余的钙依赖的蛋白激酶四突变体的气孔关闭(Brandt et al.,2015)。与Sn RK2s一样,CPKs可以使保卫细胞ABA响应的效应蛋白(包括SLAC1)磷酸化(Geiger et al.,2010;Brandt et al.,2015)。此外,ABA引起的钙信号可以激活CBL1/9-CIPK26模块,导致Rboh F等效应蛋白的磷酸化(Drerup et al.,2013)。除了诱导H2O2和钙信号,ABA也引发一氧化氮(NO)和磷脂分子如磷脂酸的合成(Hou et al.,2016)(图3)。NO导致邻近Sn RK2s的催化中心的半胱氨酸残基的巯基亚硝基化,导致Sn RK2失活(Wang et al.,2015)。NO也导致PYLs蛋白的酪氨酸硝基化以及半胱氨酸残基的巯基亚硝基化(Castillo et al.,2015)。酪氨酸硝基化抑制PYL活性并伴随多聚泛素化和蛋白酶体介导的PYLs降解。磷脂酸通过结合和激活Rboh D和Rboh F,参与ABA信号转导(Zhang et al.,2009)。综上所述,SLAC1、Rbohs以及其他ABA响应效应蛋白的调节依赖于一个由PYL-PP2C-Sn RK2核心途径以及钙、ROS、NO、磷脂和上述其他蛋白激酶途径组成的复杂的调控网络(图3)。

1 0 冷害和热害胁迫信号

冷害胁迫极大地影响植物新陈代谢和基因表达。低温对植物代谢的影响来自直接抑制代谢酶,或者基因表达的重组(Chinnusamy et al.,2007)。温带植物暴露于低温,非冻害的温度能提高其对冻害胁迫的耐受能力,这一过程称为冷驯化。冷胁迫能迅速引发许多转录因子的表达,包括AP2家族转录因子CBFs,从而激活大量的下游冷应答(COR)基因的表达(Chinnusamy et al.,2007)。CBF基因的表达由包括b HLH转录因子ICE1在内的上游转录因子控制的。ICE1通过SUMO类泛素化和多聚泛素化及随后的蛋白酶体降解。上述过程分别由SUMO E3连接SIZ1和E3泛素连接HOS1介导(Chinnusamy et al.,2007)。冷胁迫诱导的CBF和COR基因的表达也受生物节律控制,后者的活性受质体逆向信号四吡咯的昼夜的振荡调控(Noren et al.,2016)。

图4 冷胁迫感受和信号转导 

质膜蛋白COLD1感受寒冷胁迫,产生胞质Ca2+信号。CPKs和CBLsCIPKs传导Ca2+信号激活MAP激酶联级,激活的MPKs使TFs如CAMTAs和ICE1/2磷酸化,诱导冷响应基因的表达。通过一个未知的机制,冷胁迫也激活了OST1(SNRK2.6),后者抑制HOS1,同时磷酸化并激活ICE1。箭头表示激活,虚线表示可能存在的调节。

Ding等(2015)最近报道,冷胁迫激活Sn RK2.6/OST1,Sn RK2.6与ICE1互作并磷酸化ICE1,激活CBF-COR基因表达,并增加冻胁迫的耐受能力。此外,冷害激活Sn RK2.6抑制ICE1和HOS1之间的相互作用,阻止ICE1的降解。冷害胁迫诱导的Sn RK2激活并不依赖于ABA,尽管其仍受ABI1和其他PP2Cs负调控。因此,PYL ABA受体可能并不参与冷诱导的Sn RK2的激活。与报道冷胁迫激活Sn RK2.6有所不同,Boudsocq等(2004)的结果显示,所有10个拟南芥Sn RK2s都不被冷胁迫激活。

图5 系统性胁迫信号转导模型

局部胁迫会产生H2O2和Ca2+信号。Ca2+信号激活CPKs和CBLsCIPKs,后者磷酸化并激活Rboh D。处于激活状态的Pboh D产生H2O2,H2O2通过细胞壁扩散到另一个相邻细胞,在这个相邻细胞中可能通过RLKs类似GHR1诱发Ca2+信号。H2O2可能激活细胞表面的Ca2+信号,并通过PIP水通道进入细胞内,然后激活细胞内Ca2+信号。Ca2+和H2O2信号的相互激活产生自动传输的钙和ROS波,传输到远端组织中,引起系统胁迫反应和适应性反应。虚线表示可能存在的调节。

Teige等(2004)研究表明,冷胁迫和盐胁迫激活拟南芥MAP2K MKK2,并控制COR基因表达,调控植物耐冷性和耐盐能力。MKK2上游的MAP3K MEKK1以及下游的MPK4和MPK6,都能被各种胁迫包括低温所激活。药理学研究表明,膜流动性、细胞骨架以及钙内流都与冷胁迫调节的COR基因和MAPKs有关(Sangwan et al.,2002)。类受体激酶CRLK1可能连接了冷胁迫介导的钙信号和MAPK级联途径,这是由于CRLK1结合钙和钙调蛋白,并与MEKK1相互作用,是冷胁迫激活MAPK所必需的(Yang et al.,2010)。由此可见,冷胁迫影响膜流动性,这可能被质膜蛋白如钙通道或相关蛋白感知,导致钙离子内流并激活钙响应的蛋白激酶(CPKs和CRLK1)和MAPK级联,调节COR基因表达(图4)。在未来,有必要使用遗传、分子和生化分析方法,进一步阐明这些激酶的作用以及它们之间、它们与Sn RK2.6之间在冷胁迫下的关系。

热胁迫诱导HSPs表达,其中许多HSP可作为分子伴侣防止蛋白质变性和维持体内蛋白平衡(Scharf et al.,2012)。与哺乳动物热胁迫转录因子(HSFs)类似,热胁迫下植物HSFs从与HSP70和HSP90结合和抑制状态下释放出来,并结合热胁迫导致的错误折叠的蛋白。因此,HSFs可用来激活热胁迫应答(Scharf et al.,2012)。热胁迫也激活MAPKs并调节HSP基因的表达(Sangwan et al.,2002)。MAPK的激活可能与热胁迫诱发的膜流动性和钙信号改变有关,后者对与HSP基因表达和耐热性很重要(Sangwan et al.,2002)。冷和热胁迫信号之间的共同特征是不限于膜流动性的改变,钙信号和MAPK激活,还包括ROS、NO、磷脂信号、蛋白质SUMO类泛素化和蛋白酶体降解(Chinnusamy et al.,2007;Scharf et al.,2012)。

1 1 系统性的信号转导

病原体感染和机械损伤引发植物系统性响应。同样,干旱、盐害、冷害、热害、高光强等非生物胁迫也引起系统性反应,局部胁迫处理不仅会导致局部产生反应,还会在远端组织引发反应,导致系统性获得适应(SAA)。SAA涉及电信号和液压信号,以及钙信号和ROS波动信号的长距离传导(Choi et al.,2014;Miller et al.,2009)。胁迫诱导的钙信号和ROS信号可以1000微米每秒的速度移动,该现象已在钙敏感荧光蛋白(Choi et al.,2014)和ROS应答启动子驱动的荧光素酶报告基因表达系统(Miller et al.,2009)中分别被观察到。钙信号和ROS分别已被证明参与远端组织转录调控(Choi et al.,2014;Miller et al.,2009)。ROS波动需要质膜NADPH氧化酶Rboh D的参与(Miller et al.,2009),而钙波动取决于参与钙诱导的钙释放的液泡离子通道TPC1的参与(Choi et al.,2014)。Rboh D可以被钙依赖的蛋白激酶CPK5所磷酸化。CPK5的激活可由ROS介导,这是系统性防御反应所必需的(Dubiella et al.,2013)。由此得出这样一个模型:NADPH氧化酶介导ROS生成,触发胞质钙信号通过钙调蛋白激酶激活更多的NADPH氧化酶类,从而在ROS和钙信号之间生成一个放大信号的正反馈环(图5)。Rboh D所产生的H2O2可能通过细胞质膜内在蛋白/水通道(PIP)进入细胞(Grondin et al.,2015),而质膜钙通道的激活可能需要GHR1(Hua et al.,2012)或RLK类似物的参与,ROS是否能激活质膜钙通道尚未确定。此外,目前尚不清楚钙和ROS波动是否与长距离电信号传导有关。

1 2 结论和展望

植物细胞信号对盐害、干旱胁迫和胁迫激素ABA的响应,在很大程度上取决于Sn RK蛋白激酶家族。Sn RKs与酵母和哺乳动物中感应细胞能量状态的关键感受器SNF1和AMPK相关(Hardie et al.,2016)。在植物中,非生物胁迫通过抑制光合作用和释能分解反应,减少能源供给。因此,在进化过程中SNF1/AMPK相关的激酶数量不断增加并表现出多样性,从而调控各种非生物胁迫。Sn RK1s是SNF1/AMPK直系同源物,参与植物代谢的调节过程。所有Sn RK2s都参与渗透胁迫和ABA信号转导,而Sn RK3s是离子动态平衡的关键调节器,是植物适应土壤中盐胁迫和养分胁迫所必需的。许多胁迫信号途径也涉及钙依赖的蛋白激酶CPKs。CPKs激酶功能域与Sn RKs的激酶功能域高度同源(Hrabak et al.,2003)。此外,事实上几乎所有胁迫途径都涉及到MAPKs,MAPKs是从真菌到植物再到后生动物中保守的胁迫信号。其他保守特性包括广泛使用的钙、ROS、NO和脂质分子作为次级信号分子,但这些次级信号分子的产生和转导在植物中与其他生物有所不同。

研究植物的非生物胁迫,鉴定胁迫感受器仍然是一个重要但极富挑战性的目标。高效的基因编辑技术和化学遗传方法将帮助我们克服由于基因冗余造成的胁迫感受器的遗传筛选上的困难。目前,各种细胞器在胁迫感受和应答过程中的作用逐渐显现,逐步揭示了胁迫信号分散感受的模型(图1)。尽管来自于受干扰的细胞器的分散信号如何整合仍不清楚,但这一模型仍有助于我们理解植物胁迫感受和胁迫抗性。由于植物胁迫应答必须与生长和发育相协调,理解胁迫信号和激素,以及生长和发育途径之间的相互关联就显得尤为重要。同样,应当更多关注植物如何同步响应多个非生物胁迫,以及非生物和生物胁迫信号之间的相互关联,因为目前为止大部分的非生物胁迫研究一直在无菌实验室进行。然而在自然环境中,植物与昆虫和微生物共存。根和地上部分很可能包括许多有益的细菌和真菌帮助植物抵御胁迫。了解细菌和真菌如何提高植物抗逆性,可以增加我们利用这些有益生物的能力,同时还有助于我们深入了解植物的胁迫抗性。