学术发布 | 《中国宏基因组学第二代测序技术检测感染病原体的临床应用专家共识》发布
推荐理由：11月出版的《中华传染病杂志》发布了《中国宏基因组学第二代测序技术检测感染病原体的临床应用专家共识》。病原学诊断始终是感染性疾病诊断中最重要的一环。传统的病原学诊断是临床医师根据患者的临床表现做出一系列鉴别诊断，然后针对这些进行检测，通常一个检测只能对应一种病原体，而宏基因组学第二代测序技术（二代测序） 能覆盖更广范围的病原体。本专家共识就二代测序的临床应用范围、样本采集、分析解读 和诊断效能等进行了证据总结和意见推荐。
❑ 若怀疑细菌、真菌、DNA病毒、寄生虫、不典型病原体感染且需进行二代测序检测时，建议采用DNA检测；若怀疑RNA病毒感染时，则建议采用RNA法检测。
❑ 对于怀疑中枢神经系统急性感染的患者，如有条件，推荐在抽取脑脊液时同步留取2 ml脑脊液标本保存于-16～20℃冰箱。在完成常规生物化学检查和培养之后，若3 d内未获得明确的病原学依据且经验性抗感染治疗无效，推荐对留存脑脊液标本进行二代测序检测。若未留存标本，可重新采集标本。
❑ 对于疑似中枢神经系统病毒感染的患者，如有条件，推荐在抽取脑脊液时同步留取2 ml脑脊液标本保存于-16～20℃冰箱。在传统PCR分子检测（包括多重探针分子PCR方法）后若未能获得明确的病原学依据，推荐对留存脑脊液标本进行二代测序检测。若未留存标本，可重新采集标本。
❑ 对于慢性中枢神经系统感染及需要随访病原学证据的患者，可首选二代测序进行检测。
❑ 对于怀疑血流感染的患者，如有条件，推荐在抽取血培养标本时同步留取2 ml血标本，分离血浆后保存于-16～20℃冰箱，血培养3 d未报阳且经验性抗感染治疗无效时，推荐对留存血标本进行二代测序检测。若未留存标本，可重新采集标本。
❑ 对于呼吸道感染患者，若3 d内未通过传统实验室检查获得明确的病原学依据且经验性抗感染治疗无效，推荐留取呼吸道标本进行二代测序检测。
❑ 对于高度怀疑病毒性肺炎且病情持续进展的患者，可先完善呼吸道病毒多重PCR检测，若为阴性，再行二代测序检测，并应同时进行核酸RNA反转录。
❑ 采集样本送检二代测序必须严格遵守无菌原则。
❑ 样本应直接从患者感染部位的体液或组织中进行采集。
❑ 对于局灶脓肿或组织感染患者，二代测序的总体灵敏性和特异性均较好，其中对细菌检测的灵敏性优于真菌。
❑ 对于呼吸道感染，二代测序在病毒及少见病原体的检测中体现出较好的检测效能；但在细菌、真菌等病原体的检测中，二代测序尚不能准确判断菌群定植或感染状态，仍需依赖临床医师结合患者病情进行进一步分析。
本专家共识通信作者、复旦大学附属华山医院感染科张文宏教授认为，病原学的精准诊断对感染性疾病的诊断非常重要。宏基因组学第二代测序技术检测具有无偏倚性、广覆盖、快速等优点，能覆盖更广范围的病原体。本专家共识就第二代测序技术的临床应用范围、样本采集、分析解读和诊断效能等进行了意见推荐，建立了中国感染病原体宏基因组学检测的标准规范。
——原文：《中华传染病杂志》编辑委员会.中国宏基因组学第二代测序技术检测感染病原体的临床应用专家共识[J].中华传染病杂志，2020，38（11）：681-689.DOI：10.3760/cma.j.cn311365-20200731-00732.
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（文/复旦大学附属华山医院感染科 艾静文）
编辑：王 丽
排版：高 冀
《中华医学信息导报》2020年21期第14版