生活中，我们常常会做“扫码”这个动作：在商场购买商品时需要扫条形码结账；之后再扫二维码支付；疫情期间我们还拥有一个健康码，记录或显示自己的行程。那么，你听说过DNA条形码吗？它是用来做什么的？和普通条形码有什么区别？这还得从条形码的工作原理说起。条形码随处可见，现在许多便利店都设置了自助结账机，很多人都有过亲手扫描条形码的经历。只要把条形码对准扫描器，“滴”地一声，商品的名称和价格便统统出现在显示器上。不同的条形码在我们看来相差无几，由宽度不等的黑条和白条排成平行线图案。之所以选择黑白两色（而不是其他颜色组合），是因为这两种颜色对光线的反射率差别大，有利于条码扫描器接收强弱不同的反射光信号。这些光信号由光电转换器转换成相应的电信号，输出到放大整形电路进行进一步处理，转化成计算机系统能够识别的数字信号。条形码中宽窄不同的黑白竖线是按照一定的编码规则排列的，竖条宽度不同，电信号持续时间就不同。根据码制所对应的编码规则，译码器便可将数字信号翻译成数字以及字符信息，这就是条形码的工作原理。那什么是DNA条形码呢？从字面上看，DNA条形码就像是要用DNA做出我们可以看到条形码，事实上却并非如此。DNA是一种存在于生物体内的、肉眼不可见的生物大分子，它看不见摸不着，并不能像商品条形码那样进行扫码识别。我们知道，DNA由A、T、C、G四种碱基排列组合而成，如果能找到一段较短的序列，这段序列对不同生物来说，碱基的排列顺序不同（就像二维码竖条的排列顺序不同），那就可以用于区分不同的生物。假设有一段基因序列，小狗是AAAA，而小猫是TTTT，就可以利用这段基因区分小猫和小狗。如果我们进一步找到一段足够区分所有生物（或大部分生物）的基因片段，就可以将其作为物种快速鉴定的标签，建立DNA序列和生物物种之间的一一对应关系，这就是“DNA条形码”的基本思路。不同物种的同一基因片段存在差异，红绿蓝黑分别代表ATCG四种碱基，图片来源 uvmgg.fandom简单来说，DNA条形码就是一段DNA序列，一段在不同物种间存在差异、但在种内高度保守且稳定遗传的DNA序列。这种DNA条形码并不会直接呈现在我们面前，但其信息可以储存在基因数据库中。迄今为止，世界各地都建立了许多包含DNA条形码的数据库，例如加拿大生物多样性基因组学中心开发的BOLD数据库，美国国家生物技术信息中心建立的NCBI数据库，欧洲生物信息研究所的EMBL-EBI数据库等。相对于短小精干的DNA条形码，任何生物的基因组都是非常巨大的，我们怎么从庞大的基因组中，识别出特定的DNA条形码呢？像大海捞针一样从头到尾检索整个基因组序列显然是不切实际的，这时，我们就需要借助特定的分子生物学技术了。其中最广为人知的一种方式就是聚合酶链式反应，也就是我们常说的PCR。PCR是一种用于扩增特定DNA片段的分子生物学技术，它不仅可以从庞大的基因组中针对性地“找到”我们想要的目的基因片段，还可以将其大量复制，以提高碱基的响应值，便于读取基因信息。应用DNA条形码鉴定微生物样品的操作流程，图片来源 DNA Bar-Code for Identification of Microbial Communities: A Mini-Review，Dhiraj Kumar Chaudhary and Ram Hari Dahal, April 2017; Project: Antimicrobial Resistance, Figure 1
有了PCR技术和包含各种DNA条形码的数据库，进行物种识别就容易多了。首先，我们要提取待测个体的DNA，接着利用PCR技术，将DNA条形码从生物庞大的基因组中调取出来，并“读”出其碱基排列顺序。然后，我们将这个序列与数据库中已有的数据进行比对，根据比对结果就能判断生物的物种信息了。如果数据库中没有与这段序列相匹配的信息，那就要考虑是不是发现了新物种。对于很多难以通过外观进行区分的物种（例如很多鸟类外形相似），DNA条形码能从遗传学意义上加以鉴别。
DNA条形码是如何工作的？（1：未知物种；2：DNA提取；3：PCR扩增；4：DNA测序；5：条码数据库比对；6：分析匹配度；7：确定物种）图片来源 DNA barcoding in the spotlight at 2018 FBIP Forum by Dane McDonald, Jul 19, 2018
早在2015年，中国科学院植物研究所就开通了“中国珍稀濒危植物DNA条形码鉴定平台”，为珍稀濒危植物的鉴定提供了技术支撑。除了物种的鉴定与挖掘，DNA条形码技术还有很多其他应用。比如检测肉类产品是否掺假，当肉类食品制作成肉丸或肉泥时，质检人员就很难通过外形判断肉的种类，DNA条形码这时候就派上用场了，哪怕只有微量的DNA，PCR技术也能捕捉并放大这种信息，让造假无处遁形。再比如利用DNA条形码技术“检查入侵”，这里的“入侵”指的是外来物种入侵。我国是外来物种入侵最严重的国家之一，在出入境检疫过程中，有时会截获一些残缺不全的动物（尤其是节肢动物）组织。由于残缺不全，通过传统的形态学鉴定很难判断这些组织究竟属于哪些物种。但DNA条形码技术不会受到样本不完整的影响，依旧可以准确识别物种信息，找出潜在的入侵物种。综上，我们看到条形码是利用宽窄不同、黑白相间的线条来表示特定的商品，而DNA条形码则是利用不同物种特定的、与其他物种相区别的基因片段来标识身份。
相信在未来，随着我们对物种（尤其是其分子遗传特征）认识的不断深入，DNA条形码技术会得到更广泛的应用。
原标题：你的DNA还可以做条形码！
来源：蝌蚪五线谱
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编辑：Eric
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