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近日，Science在线发表了美国爱荷华州立大学等单位合作的题为“De novo assembly, annotation, and comparative analysis of 26 diverse maize genomes”的研究论文，该论文完成了26 个不同玉米基因组的从头组装、注释和比较分析。
玉米是世界范围内种植的重要作物。随着玉米在世界各地传播，对当地环境的选择导致了变异，但对基因组差异的影响尚未得到量化。该研究报告了 26 个自交系的从头基因组组装、转录组、注释和甲基化组，这些近交系是玉米嵌套关联图 (NAM) 的起始植株。在这些不同的基因组中，泛基因的数量超过10.3万个，其中大约三分之一分布在所有基因型中。结果表明，玉米古老的四倍体性状至今仍在通过分离而不断退化。重复序列的良好连续性和着丝粒的完整注释揭示了主要细胞学标志物的额外变化。该研究结果表明，结合结构变异和单核苷酸多态性可以提高定量作图研究的能力。最后该研究还记录了 DNA 甲基化水平的变异，并证明未甲基化区域富含有助于表型变异的顺式调控元件。
原文链接：
https://science.sciencemag.org/content/373/6555/655
来源：植物科学最前沿
原文链接：http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyOTY2NDYyNQ==&mid=2247520555&idx=1&sn=292fed67ec632ed49c90d20c1b5f72e2
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