南京农业大学熊爱生课题组发布芹菜基因组

科技工作者之家 2020-01-11

来源:BioArt植物

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芹菜(Apium graveolens L.)为伞形科(Apiaceae)一、二年生草本植物,原产于地中海和中东地区,目前在全球范围内均有栽培,是一种世界性的蔬菜。芹菜以嫩叶和叶柄作为主要的食用部位。芹菜含有丰富的维生素、类胡萝卜素、蛋白质和膳食纤维等多种营养成分,其茎、叶、种子中还含有多种挥发油化合物、类黄酮、不饱和脂肪酸等具有生理活性的物质,具有很高的食用和药用价值。随着人民生活水平提高和健康意识的增强,芹菜的需求量越来越大,这也对芹菜的遗传育种和基础理论研究提出了更高的要求。

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Fig. 1: Georeferenced records and an image of celery.

2020年1月,南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室、园艺学院蔬菜学国家重点学科熊爱生教授课题组在Horticulture Research发表了题为The genome sequence of celery (Apium graveolens L.), an important leaf vegetable crop rich in apigenin in the Apiaceae family的研究论文。该研究构建了六个不同长度DNA文库,通过对芹菜基因组进行测序,共获得600.8 Gb的数据量,经过组装后得到2.21Gb的芹菜基因组序列,预测出34,277个编码蛋白质的基因。

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Fig. 2: Comparative genomic and phylogenetic relationship analyses.

基因组加倍事件是植物基因组进化的重要驱动因素,本研究表明,芹菜在进化过程中发生了两次全基因组加倍,而且存在大量的基因家族扩张和收缩。芹菜基因组含有1,698个转录因子,约占整个基因组总基因数的5%。芹菜素具有多种生物活性和药理功能,而芹菜中含有大量的芹菜素。芹菜还具有独特的风味,这与萜类物质的存在密不可分。根据芹菜基因组数据,本研究对芹菜素、萜类等物质合成途径相关基因进行了鉴定与分析。

南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室、园艺学院蔬菜学国家重点学科的李梦瑶博士和冯凯博士为本论文的共同第一作者,熊爱生教授为通讯作者。该研究得到国家自然科学基金、江苏省农业科技自主创新资金、教育部新世纪优秀人才等项目的资助。

论文链接:

https://www.nature.com/articles/s41438-019-0235-2

来源:bioartplants BioArt植物

原文链接:http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU3ODY3MDM0NA==&mid=2247493617&idx=4&sn=3a344cb17752fd83687f5ee112923238&chksm=fd737d96ca04f480bc7becb45ef9fcecd624937593f0337e6c268eb3820b921806c245aa94bd&scene=27#wechat_redirect

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基因组 南京农业大学 芹菜

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