QB｜面向消费者的基因检测，真的可靠吗？可复制性如何？

图1：美国(A)和中国(B)主要DTC-DC公司的消费者每年增长趋势

接下来作者研究了中美DTC-GT公司的研究发表情况（图2）。相关研究重点是人类健康、性状和行为。中国服务商发表的研究主要是关于地理祖先、人群基因组学以及相关方法的开发。

图2：美国和中国DTC-GT公司发表的科学文献对比

作者还调研了中美DTC-GT用户参与遗传学研究的意愿。截至2019年10月，98.0%的WeGene档案（注：一个用户账户可能包括多个基因档案）都附有消费者同意将基因和表型数据用于相关科学研究的同意书。这比23andMe用户80%的参与率要高得多, 中国用户激活率、保留率、基本信息(性别、出生日期、居住地、祖籍)共享程度也较高（图3）。

图3：WeGene数据库中记录的基本信息和表型共享情况

此外，作者评估了阿尔茨海默病（AD），2型糖尿病（T2D）和精神分裂症（SP）三个多基因疾病的风险分类准确度随样本量扩大的变化。结果表明：1）用户数量的增加并没有改变整体的多基因风险得分(PRS)分布, 而是增加了平滑度（图4）。

图4. 三种多基因疾病（AD、T2D和SP）的PRS随样本量扩大的变化

2）在报告更新前后, 疾病风险水平的重分类情况并不严重, 说明疾病风险预测具有一定的稳定性（图5）。

图5. 在报告更新前后, 三种多基因疾病（AD、T2D和SP）的风险水平重分类情况

3）随着用户数量的增加和新的GWAS结果的整合，模型预测疾病风险水平和家族史之间相关性的能力有望得到改善（图6）。

图6. 用户数量增加及报告更新对AD预测模型和家族史相关性的影响

在GWAS研究的可复现性方面, 作者选择了7份来自WeGene Biobank的相关研究作为验证, 包括最初在欧洲人群中发现的单核苷酸多态性（SNPs）以及样本量相对较小的研究。结果表明，对于某些关于东亚人的小样本GWAS，WeGene Biobank可以作为GWAS发现和验证的数据集。

最后，作者认为2017年和2018年间美国和中国的DTC-GT市场快速增长, 中国有可能成为新兴DTC-GT市场的强大力量。但其中还有一些特点值得讨论:1） DTC-GT在中国的接受度和普及度严重偏向年轻人, 其中80%以上生活在一线城市。倾斜的年龄和居住地构成限制了中国DTC-GT人群的临床研究机会和应用。这在一定程度上限制了研究结果的重复性、扩展性和可靠性。2）倾斜的年龄构成也带来一些好处, 如用户参与数据共享的开放性和意愿，以及反馈报告、第三方报告参与和表型收集等方面。3）DTC-GT的可重复性总体较为乐观, 然而中美人种差异导致一些SNP与疾病的关联无法在WeGene用户数据中得到复现, 作者提出风险预测模型应当就这一特点进行适当优化。4）中国基于DTC-GT的生物库在学术和工业方面都显示出了强大的潜力。