1月24日,北京大学工学院生物医学工程系教授朱怀球团队最新研究预测表明,蝙蝠和水貂可能是新型冠状病毒的两个潜在宿主,蝙蝠是它的最主要来源,中间宿主可能是水貂。研究预测还表明:武汉新型冠状病毒和SARS冠状病毒一样,具有强感染性。相关研究发表1月24日的预印版平台 BioRxiv 上,题为Host and infectivity prediction of Wuhan 2019 novel coronavirus using deep learning algorithm(深度学习算法预测新型冠状病毒的宿主和感染性)。该研究用基于深度学习算法开发的VHP(病毒宿主预测)方法,来预测新型冠状病毒潜在宿主。预测结果提示,新型冠状病毒具有与严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)、蝙蝠SARS样冠状病毒(Bat SARS-like CoV)和中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)类似的感染人类的强大潜力。研究提示,与感染其他脊椎动物的冠状病毒相比,蝙蝠SARS样冠状病毒与新型冠状病毒具有更相似的感染模式。此外,通过比较所有宿主在脊椎动物上的病毒传染模式,发现水貂病毒的传染性模式更接近新型冠状病毒。这说明,蝙蝠和水貂可能是新型冠状病毒的两个潜在宿主。武汉新型冠状病毒来源及宿主最新研究进程一览
1月22日,国家疾控中心主任、中国科学院院士高福在国务院召开的首场武汉疫情新闻发布会上表示,目前来看,新型冠状病毒的来源是武汉一家海鲜市场非法销售的野生动物。
2020年1月21日,中国科学院上海巴斯德研究所郝沛研究员、军事医学研究院国家应急防控药物工程技术研究中心钟武研究员和中科院分子植物卓越中心合成生物学重点实验室李轩研究员合作,在SCIENCE CHINA Life Sciences(《中国科学:生命科学》英文版),在线发表了题为:Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission 的研究论文。研究发现武汉冠状病毒和SARS/类SARS冠状病毒的共同祖先都是和HKU9-1类似的病毒。并推测和SARS一样,武汉冠状病毒的自然宿主也可能是蝙蝠,在从蝙蝠到人的传染过程中很可能存在未知的中间宿主媒介。
2020年1月22日,北京大学、广西中医药大学、宁波大学及武汉生物工程学院联合攻关,在Journal of Medical Virology 杂志发表题为:Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross‐species transmission from snake to human的研究论文,该研究团队发现蛇是最有可能造成当前武汉新型冠状病毒(2019-nCoV)感染的野生动物。(点击阅读)。
然而,仅仅一天之后的2020年1月23日,发现SARS病毒来源于中华菊头蝠的中科院武汉病毒所石正丽团队在预印本网站BioRxiv在线发表题为:Discovery of a novel coronavirus associated with the recent pneumonia outbreak in humans and its potential bat origin的研究论文。研究对先前的结果提出了新的挑战,认为蝙蝠才是最有可能的携带武汉新型冠状病毒(2019-nCoV)的野生动物。
病毒感染力方面,朱怀球团队研究表明,新型冠状病毒的6个基因组都极有可能感染人类。预测结果提示,新型冠状病毒具有与严重急性呼吸综合征冠状病毒(SARS-CoV)、蝙蝠SARS样冠状病毒(Bat SARS-like CoV)和中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV)类似的感染人类的强大潜力。课题组成员、浙江大学医学院第一医院、传染病诊治国家重点实验室副主任肖永红肖永红:新型冠状病毒肺炎暴发以来,病毒的传染源一直没有找到。我们利用深度学习算法,分析了现有数据,包括新型冠状病毒及其他冠状病毒的基因序列,以及GenBank(基因数据库)中所有可用的脊椎动物病毒数据等。研究发现,新型冠状病毒与其他冠状病毒有相似的传染过程。蝙蝠身上有多种冠状病毒,这些冠状病毒可能先传染至哺乳动物,再传染到人。比如MERS病毒,中间宿主就是骆驼。对于新型冠状病毒来说,研究预测,蝙蝠是它的最主要来源,中间宿主可能是水貂。新京报:研究主要基于日前公布的新型冠状病毒全基因序列吗?
肖永红:是的。对科学研究来说,病毒全基因序列非常重要。新型冠状病毒和相似病毒的进化分析,新型冠状病毒的检测方法,都基于全基因序列。另外,病毒发病机制研究、新型冠状病毒治疗药物及疫苗的研发,也基于全基因序列。新京报:从全基因序列看,新型冠状病毒与SARS病毒有什么关联?肖永红:我认为它和SARS病毒的类似度很高。首先,新型冠状病毒与SARS病毒同属于冠状病毒的β属,而且两种病毒的基因组序列80%相同,同源性很高。其次,从现有研究看,两种病毒入侵人体细胞的主要受体都是ACE2。第三,新型冠状病毒感染的肺炎发病时间也和SARS相似。新京报:昨天中国疾控中心首次公布成功分离的我国第一株病毒毒种信息及其电镜照片,这意味着什么?肖永红:全基因序列是拿到了病毒的信息,中国疾控中心在实验室中把病毒培养出来了,这对于研究病毒致病机制、药物研发都非常有帮助,奠定了非常好的基础。通俗地说,全基因组序列找到了“贼”的证据,现在是把“贼”抓住了。朱怀球教授、博士生导师,现任北京大学工学院副院长,兼任中国医药生物技术协会生物医学信息技术分会常务委员、北京生物信息学研究会秘书长、中国生物工程学会计算生物学与生物信息学专业委员会委员、Int. J. Comput. Intelligence in Bioinformatics and Systems Biology (IJCIBSB) 副主编、以及Dataset Papers in Biol.、Hans J. Comput. Biol.、J. Metabol. Sys. Biol.、British J. Health Informatics Monitoring、J. Biochem. Mol. Biol. Res.等国际期刊编委、《北京生物医学工程》编委。
https://doi.org/10.1101/2020.01.21.914044
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