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2月3日，国际顶尖学术期刊 Nature 杂志同日上线两篇关于武汉新型冠状病毒的研究论文，这也是 Nature 杂志首次发表新型冠状病毒研究论文。这两篇论文分别来自中科院武汉病毒研究所石正丽团队和复旦大学公共卫生学院张永振团队。这两篇论文以加快评审文章形式上线，分别投稿于1月20日和1月7日。
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自18年前SARS爆发以来，在其自然宿主蝙蝠中发现了大量严重急性呼吸综合征相关冠状病毒（SARSr-CoV），先前的研究表明，其中一些蝙蝠来源的SARS相关冠状病毒可能会感染人类。在这篇论文里，石正丽团队报道和表征了引发此次武汉肺炎疫情的新型冠状病毒（2019-CoV）。
该疫情始于12月12日（第一位住院患者时间），在疫情爆发早期，从五名患者中获得了病毒全长基因组序列。这些病毒彼此几乎相同，并且对SARS冠状病毒有79.5％的基因组序列相似性。此外，武汉新型冠状病毒（2019-nCoV）在全基因组水平上与蝙蝠冠状病毒具有96％的同源性。七个保守的非结构蛋白的成对蛋白序列分析表明，该病毒属于SARSr-CoV物种。然后从危重病人的支气管肺泡灌洗液中分离出2019-nCoV病毒，可以被几名患者的血清中和。重要的是，该研究从分子水平揭示了2019-nCoV与SARS-CoV使用相同受体ACE2进入细胞。该论文主要内容已于1月23日发表于预印本网站 BioRxiv 。此次是经同行评议后正式发表在 Nature 杂志。石正丽实验室曾成功证实蝙蝠是SARS冠状病毒的自然宿主，并首次在我国蝙蝠体内检测到烈性病毒尼帕病毒和埃博拉病毒抗体，发现多个蝙蝠携带的新病毒。这些研究开创了我国系统研究蝙蝠病毒的先河，对动物源新发病毒病原学、新病毒发现等研究方向的发展起到了积极推动作用。石正丽团队也成为国际蝙蝠病毒研究领域最有影响力的实验室之一。![]()
张永振率先于2020年1月11日公布新型冠状病毒基因组序列信息，大大加速了新冠病毒相关研究。近年来，SARS和寨卡病毒等新兴传染病对公共卫生安全构成了重大威胁。尽管已经进行了广泛的研究，但是何时、何地、为何出现新疾病仍然有很大不确定性。近段时间，武汉发生了呼吸系统疾病，自2019年12月12日第一例患者住院以来，现在已有超过17000名确诊病例。流行病学调查表明，此次暴发与武汉华南海鲜市场有关。张永振团队研究了一名在华南海鲜市场工作的患者，该患者于2019年12月26日入住武汉市中心医院，入院时患有严重的呼吸系统综合症，包括发烧，头晕和咳嗽。通过对患者支气管肺泡灌洗液样本的RNA测序鉴定出了一种来自冠状病毒科的新型RNA病毒。
对其完整病毒基因组（29903个核苷酸）的系统进化分析表明，该病毒与一组SARS样冠状病毒（Betacoronavirus属，Sarbecovirus亚属）最为相似（89.1％核苷酸相似性）。
这次疫情突出表明，病毒从动物身上逃逸能力正在引起人类严重疾病。
张永振团队
张永振团队所在的上海市公共卫生中心生物安全三级实验室是全世界最顶尖的病毒领域实验室（之一），在全球6000多种病毒中，张永振团队就发现了2000多种，在国际病毒学分类委员会为病毒划分的14个目中，该实验室贡献了其中3个目。论文链接：
https://doi.org/10.1038/s41586-020-2012-7
https://doi.org/10.1038/s41586-020-2008-3
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