一种蛋白质翻译后修饰的发现方法

• 摘要：

  本发明提供一种蛋白质翻译后修饰的发现方法,包括:利用蛋白质样品的实验串联质谱数据中的肽色谱保留时间以及肽质量计算所有谱图之间的谱图差异向量;建立可能包含修饰质量的候选修饰质量区间;在每个所述的候选修饰质量区间上,估计所述谱图差异向量的混合分布,计算所述混合分布中各个分布的标准差,由所述标准差确定所述候选修饰质量区间内由所述蛋白质翻译后修饰导致的分布;计算由所述蛋白质翻译后修饰导致的分布的均值,由所述均值的质量分量得到所述蛋白质翻译后修饰的精确质量实验值,由所述均值的保留时间分量得到所述蛋白质翻译后修饰对肽色谱保留时间的影响.本发明的方法具有高效、准确、鲁棒的优点.

• 专利类型：

  发明专利

• 申请/专利号：

  CN200910076588.8

• 申请日期：

  2009.01.09

• 公开/公告号：

  CN101477089

• 公开/公告日：

  2009-07-08

• 发明人：

  付岩 贺思敏 王海鹏 孙瑞祥

• 申请人：

  中国科学院计算技术研究所

• 主分类号：

  G01N30/72(2006.01)I

• 主权项：

  1、一种蛋白质翻译后修饰的发现方法,包括:步骤1)、利用蛋白质样品的实验串联质谱数据中的肽色谱保留时间以及肽质量计算所有谱图之间的谱图差异向量,所述谱图差异向量表示了两个实验串联质谱图间的肽质量差异和肽色谱保留时间差异;步骤2)、建立可能包含修饰质量的候选修饰质量区间;步骤3)、在每个所述的候选修饰质量区间上,估计所述谱图差异向量的混合分布,计算所述混合分布中各个分布的标准差,由所述标准差确定所述候选修饰质量区间内由所述蛋白质翻译后修饰导致的分布;步骤4)、根据包含所述蛋白质翻译后修饰的分布的属性,计算所述蛋白质翻译后修饰的精确质量值以及所述蛋白质翻译后修饰对肽色谱保留时间的影响.