基于测序基因分型技术的猪SNP标记位点的分析方法

• 摘要：

  本发明提供了一种基于测序基因分型技术的猪SNP标记位点的分析方法,包括以下步骤:(1)预测用EcoRI与MspI的双酶切猪基因组所获得的酶切片段分布情况;(2)根据EcoRI与MspI的酶切识别序列设计通用接头、条形码接头及PCR扩增引物;(3)构建简化基因组测序文库;(4)利用步骤(3)构建的文库进行上机测序;(5)根据测序结果获得SNP标记位点.本发明提供的方法中所使用的酶切组合适用于所有的猪品种,利用该组合进行简化基因组测序,能够得到高于目前市场已有芯片上的SNP数目,能够用于全基因关联分析研究和基因组选择研究,同时还能保证单个个体的分型成本低于目前流行的芯片.

• 专利类型：

  发明专利

• 申请/专利号：

  CN201510669935.3

• 申请日期：

  2015.10.13

• 公开/公告号：

  CN106566872A

• 公开/公告日：

  2017-04-19

• 发明人：

  胡晓湘 谈成 李宁 黄卓林 任江丽

• 申请人：

  中国农业大学

• 主分类号：

  C12Q1/68(2006.01)I,C,C12,C12Q,C12Q1

• 分类号：

  C12Q1/68(2006.01)I,C,C12,C12Q,C12Q1,C12Q1/68

• 主权项：

  一种基于测序基因分型技术的猪SNP标记位点的分析方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)预测用EcoRI与MspI的双酶切猪基因组所获得的酶切片段分布情况;(2)根据EcoRI与MspI的酶切片段分布特点设计通用接头、条形码接头及PCR扩增引物;(3)构建简化基因组测序文库;(4)利用步骤(3)构建的文库进行上机测序;(5)根据测序结果获得SNP标记位点.