一种基于子集错误率估计的肽鉴定方法

• 摘要：

  本发明涉及一种基于子集错误率估计的肽鉴定方法,其步骤包括:1)用质谱仪分析需要鉴定的肽样品以生成串联质谱;2)把所述串联质谱搜索包含目标肽序列的目标-诱饵蛋白质数据库,将得到的肽鉴定结果按照打分从高到低排序;3)给定打分阈值x,采用迁移FDR方法估计打分高于x的第k类肽鉴定子集的错误率FDRk(x);4)通过调整打分阈值x找到的x最小值,使得估计出的FDRk(x)小于给定的错误率控制水平α,所得打分高于x的第k类肽鉴定结果即为可以接受的可靠鉴定结果.本发明通过迁移FDR方法估计子集错误率,进而通过该子集错误率得到肽的可靠鉴定结果,具有更高的鉴定准确率.

• 专利类型：

  发明专利

• 申请/专利号：

  CN201310375508.5

• 申请日期：

  2013.08.26

• 公开/公告号：

  CN103439441A

• 公开/公告日：

  2013-12-11

• 发明人：

  付岩

• 申请人：

  中国科学院数学与系统科学研究院

• 主分类号：

  G01N30/86(2006.01)I,G,G01,G01N,G01N30

• 分类号：

  G01N30/86(2006.01)I,G01N30/72(2006.01)I,G,G01,G01N,G01N30,G01N30/86,G01N30/72

• 主权项：

  一种基于子集错误率估计的肽鉴定方法,其步骤包括:1)用质谱仪分析需要鉴定的肽样品以生成串联质谱;2)把所述串联质谱搜索包含目标肽序列的目标‑诱饵蛋白质数据库,将得到的肽鉴定结果按照打分从高到低排序;3)给定打分阈值x,采用迁移FDR方法估计打分高于x的第k类肽鉴定子集的错误率FDRk(x);4)通过调整打分阈值x找到x的最小值,使得估计出的FDRk(x)小于给定的错误率控制水平α,所得打分高于x的第k类肽鉴定结果即为可靠鉴定结果.