基于圆周统计的蛋白质折叠的表征方法及系统

• 摘要：

  本发明涉及生物信息学技术领域,特别涉及一种基于圆周统计的蛋白质折叠的表征方法及系统.本发明的方法基于圆周统计对蛋白质折叠进行表征,高效、准确,即可以更快研究蛋白质的折叠,也可以更准确描述蛋白质动态变化,从而研究相关神经退行性疾病的机理.

• 专利类型：

  发明专利

• 申请/专利号：

  CN201310683271.7

• 申请日期：

  2013.12.12

• 公开/公告号：

  CN103714264A

• 公开/公告日：

  2014-04-09

• 发明人：

  魏彦杰 张慧玲 彭丰斌 孟金涛 冯圣中

• 申请人：

  深圳先进技术研究院

• 主分类号：

  G06F19/16(2011.01)I,G,G06,G06F,G06F19

• 分类号：

  G06F19/16(2011.01)I,G,G06,G06F,G06F19,G06F19/16

• 主权项：

  一种基于圆周统计的蛋白质折叠的表征方法,其特征在于,包括如下步骤:步骤1:建立第一圆周统计模型,用角度方差V(a)=1‑R(a)表征热动力学涨落;建立第二圆周统计模型,用角度协方差表征热动力学涨落;步骤2:用第一圆周统计模型或第二圆周统计模型对待研究蛋白质序列构型中两侧链之间的氢键、两主链之间的氢键及两侧链之间的二硫键进行热动力学涨落分析;步骤3:将待研究蛋白的能量力场分割为侧链与主链的相互作用能量Es‑b、不同侧链之间的相互作用能量Es‑s、不同主链之间的相互作用能量Eb‑b;分析主链上第m个氨基酸残基和第n个氨基酸残基之间的侧链相互作用能量的涨落,当涨落值大于预设链相互作用能量热涨落阈值时,对第m个氨基酸残基和第n个氨基酸残基进行标记;步骤4:分别用第一圆周统计模型和第二圆周统计模型分析不同侧链之间的二面角相互作用热涨落;当涨落值大于预设二面角相互作用热涨落阈值时,采用第一圆周统计模型表征;当涨落值小于预设二面角相互作用热涨落阈值时,采用第二圆周统计模型表征.FDA0000436299540000011.jpg,FDA0000436299540000012.jpg