发现穿山甲携带SARS-CoV-2近缘冠状病毒 |《自然》论文

科技工作者之家 2020-03-27

来源:Nature自然科研

《自然》发表的一项研究Identifying SARS-CoV-2 related coronaviruses in Malayan pangolins发现,从走私到中国的少数穿山甲中检测到的冠状病毒,与SARS-CoV-2冠状病毒具有较近的亲缘关系。这种相似程度不足以说明穿山甲是直接参与当前SARS-CoV-2暴发的中间宿主。但研究结果表明,穿山甲是冠状病毒的第二个哺乳动物宿主,应严令禁止野生动物市场交易穿山甲,从而将未来病毒感染人类的风险降至最低。


尽管有证据显示,蝙蝠可能是SARS-CoV-2的储存宿主,但目前仍不清楚哪种中间宿主动物可能帮助把SARS-CoV-2传给了人类。目前暴发的呼吸道疾病的早期病例与一家海鲜市场有关,但该市场在疫情发生后迅速进行了清理,阻碍了对SARS-CoV-2起源的动物溯源工作。一个可能宿主是穿山甲,穿山甲也是最常见的非法贩运哺乳动物,在食物和传统医药中都有使用。


中国香港大学&汕头大学的管轶和同事对取自18只马来穿山甲的样本进行了分析,这批穿山甲是2017年8月至2018年1月在中国南部开展的反走私行动中查获的。研究人员在其中5只穿山甲体内检测到了SARS-CoV-2的近缘冠状病毒。之后,研究人员又在2018年在第二个省查获的另外12只穿山甲中的3只,以及在2019年采集了样本的第三个省的1只穿山甲中,分别检测到了相似的冠状病毒。这些样本中分离的病毒与SARS-CoV-2的序列相似性约为85-92%,其中一种病毒的受体结合域序列与SARS-CoV-2具有很强的相似性——受体结合域负责编码帮助病毒进入宿主细胞的“刺突”蛋白。不过,迄今鉴定出的所有穿山甲冠状病毒序列中,都缺少在人SARS-CoV-2中观察到的一种特异性改变,这让研究人员难以确定它们在新冠病毒感染人类过程中的作用。


穿山甲是除蝙蝠外,迄今唯一报道过的受到一种SARS-CoV-2近缘冠状病毒感染的哺乳动物。这些研究结果突显出穿山甲在冠状病毒生态学中的潜在重要作用,但无法直接说明穿山甲参与了这次SARS-CoV-2感染人类的过程。作者建议,在接触这些动物时应提高警惕,同时需要对穿山甲展开进一步监测,以了解它们对于可能感染人类的冠状病毒的出现起到了哪些作用。


该研究所用数据已存入GISAID数据库(登记号为EPI_ISL_410538 - EPI_ISL_410544)和SRA数据库(BioProject 号 PRJNA606875),亦可在论文的补充信息文档中找到。


施普林格∙自然签署了一份联合声明,该声明致力于共享与新型冠状病毒爆发有关的研究数据和发现。更多信息见此。


© nature

Nature | DOI: 10.1038/s41586-020-2169-0


点击“阅读原文”查看论文英文原文

Identifying SARS-CoV-2 related coronaviruses in Malayan pangolins


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