重建物种系统发育关系的方法，你用对了吗学术资讯

近日，一篇发表在《自然》杂志的论文称，科研工作者长期使用的重建物种系统发育关系的方法存在严重缺陷。俄勒冈大学的生物学家Stilianos Louca说：“目前的研究一般使用现有的系统发育树来重建分类单元的多样化历史，我们的发现对此提出了质疑。”

在他们的论文中，Louca和英属哥伦比亚大学的进化生物学家Matthew W. Pennell提出了一个数学模型，引入了可替代变量来描述长期的进化情景。这些情景可以从系统发育数据中被准确地识别出来。

“尽管在过去的几十年里，人们开发了出一套令人印象深刻的计算方法来提取历史遗留信息，但直到现在，我们仍没有很好地理解这些系统发育树中究竟遗留了什么信息，以及哪些信息永远地丢失了。” Louca说。

Louca和Pennell的数学驱动方法精确地阐明了，在广义的生-死模型下，人们可以从现存的系统发育树中提取哪些信息。他们引入的新变量可识别且易于解释，包含了关于过去多样化动态的所有可用信息。

Pennell说：“我们认为，对这些可识别的变量进行测量和建模，为研究多样化动态提供了一种更可靠的方法。我们的发现也清楚地表明，古生物学数据对回答一些宏观进化问题仍然起着关键作用，而未来将依赖于整合分子和化石数据中的信息。”

研究人员强调，他们的研究结果并没有使进化论本身失效，而是对从遗传数据中提取何种类型的信息来重建进化路径增加了限制条件。

相关论文详见：http://dx.doi.org/10.1038/s41586-020-2176-1

科界原创

编译：灯丝

审稿：alone

责编：雷鑫宇

期刊来源：《自然》

期刊编号：0028-0836

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重建物种系统发育关系的方法，你用对了吗