意外中的意外,一条额外的蛋白条带,催生了脂肪酸合成酶调控亚基的全新发现

科技工作者之家 2020-07-22

来源:iNature

iNature

脂肪酸及其生物合成对于所有生物的生存都是必不可少的,脂肪酸是生物膜的组成部分,也是细胞的能量储备和第二信使分子前体。在细菌,酵母和植物中,脂肪酸的从头生物合成对于生存至关重要,而动物则需要额外的饮食摄取。脂肪酸合成中的细微变化会影响许多重要的细胞功能,因此与癌症和肥胖等疾病有关。鉴于脂肪酸合成的核心代谢作用,所有生物都采用了一条通用的生物合成途径,这需要四个核心代谢产物-乙酰辅酶A,丙二酰辅酶A,NAD(P)H和ATP。迄今为止,没有描述直接调节脂肪酸合成酶(FAS)活性的蛋白质。

2020年3月10日,Kashish Singh等人在Cell 在线发表题为“Discovery of a Regulatory Subunit of the Yeast Fatty Acid Synthase”的研究论文,该研究建立了一种纯化程序,该程序将从酵母酿酒中产生高活性,生物化学和结构均一的FAS,发现了一种20 kDa的额外蛋白质,可与FAS共同纯化。胰蛋白酶消化的串联质谱鉴定该蛋白为Tma17p(FASγ亚基)。总而言之,该研究描述了酵母FAS调节亚基FASγ亚基的发现。γ亚基结合稳定了旋转的FAS构象,伴随有从KS域位置重新排列到AT域位置的ACP域。 γ亚基响应其共底物NADPH的丰度来调节FAS酶的活性,诱导FAS周转的滞后行为,并抑制无效的ER催化循环。因此,γ亚基直接与FAS相互作用,调节其活性并影响其结构,包括ACP穿梭系统。


wt_a62322020072121139_b3147e.jpg


脂肪酸及其生物合成对于所有生物的生存都是必不可少的,脂肪酸是生物膜的组成部分,也是细胞的能量储备和第二信使分子前体。在细菌,酵母和植物中,脂肪酸的从头生物合成对于生存至关重要,而动物则需要额外的饮食摄取。脂肪酸合成中的细微变化会影响许多重要的细胞功能,因此与癌症和肥胖等疾病有关。


wt_a42302020722121139_b89bbc.jpg

脂肪酸生物合成的一般催化循环


鉴于脂肪酸合成的核心代谢作用,所有生物都采用了一条通用的生物合成途径,这需要四个核心代谢产物-乙酰辅酶A,丙二酰辅酶A,NAD(P)H和ATP。尽管保留了生物合成反应机制,但脂肪酸合成酶(FAS)的结构在整个生命王国中都不同。在高级真核生物中,FAS由十字形的同型二聚体形成。多个实验室进行的结构研究表明,I型真菌FAS是D3对称的2.6 MDa多酶复合物,形成长270Å,宽250Å的桶形颗粒。


wt_a12302200722121139_bc9144.jpg

蛋白纯化比较

这些研究表明,酿酒酵母FAS由形成中心轮的六个α亚基拷贝和形成粒子的两个圆顶的六个β亚基拷贝组成。合成饱和C16-C18脂肪酸链所需的所有酶促活性均位于α-亚基和β-亚基内。α亚基包含酮还原酶(KR),酮合成酶(KS)和磷酸泛酸转移酶(PPT)结构域,而β亚基包含乙酰基转移酶(AT),烯酰还原酶(ER)和脱水酶(DH)结构域。丙二酰/棕榈酰转移酶(MPT)结构域主要由β亚基的C末端部分形成,并由α亚基的N末端完成。酰基载体蛋白(ACP)域被灵活地束缚在α亚基上,其运动受到圆顶内空间限制。与ACP结合的中间体被认为以随机方式反复穿梭到所有活性位点,类似于为其他多酶复合物提出的多重随机偶联机制。


wt_a22322000722121140_c0ff8f.jpg

两种主要构型的酵母FAS的高分辨率结构测定

FAS的能量消耗和中心代谢的重要性要求严格控制其活性,这要归因于转录控制,需要通过多层ACC调控和棕榈酰的反馈抑制作用。迄今为止,没有描述直接调节FAS活性的蛋白质。同样,尚不知道随机ACP运动是否与真菌FAS圆顶的构象变化一致,或者是否需要辅助因素。

该研究建立了一种纯化程序,该程序将从酵母酿酒中产生高活性,生物化学和结构均一的FAS。在整个纯化过程中,FAS浓度从未降至0.4μM以下,有趣的是,研究人员发现了一种20 kDa的额外蛋白质,可与FAS共同纯化。胰蛋白酶消化的串联质谱鉴定该蛋白为Tma17p。另外,研究人员通过产生Δtma17敲除酵母菌株并纯化FAS来验证Tma17p。当从Δtma17菌株中纯化时,纯化的FAS馏分中不存在20 kDa的条带,从而证实了MS的结果。因此,Tma17p与FAS共纯化,并且似乎代表了酵母FAS迄今公认的未知亚基(FASγ亚基)。


wt_a72322020072121140_c68e37.jpg

文章总结

在这里,该研究描述了酵母FAS调节亚基的发现,建议将其称为FASγ亚基。最多有六个γ亚基拷贝与占据所有六个反应室的单个α6β6FAS分子结合,每个γ亚基同时接触一个α亚基和两个相邻的β亚基。 γ亚基结合稳定了旋转的FAS构象,伴随有从KS域位置重新排列到AT域位置的ACP域。γ亚基响应其共底物NADPH的丰度来调节FAS酶的活性,诱导FAS周转的滞后行为,并抑制无效的ER催化循环。因此,γ亚基直接与FAS相互作用,调节其活性并影响其结构,包括ACP穿梭系统。


来源:Plant_ihuman iNature

原文链接:https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU3MTE3MjUyOA==&mid=2247512254&idx=6&sn=50c7a7d69544b6a070abc32213f1c2eb&chksm=fce6c361cb914a77d3206edd6fedef3badb9ba8527e6c6ca6080e0d5d044d6a2cccc23ce044f#rd

版权声明:除非特别注明,本站所载内容来源于互联网、微信公众号等公开渠道,不代表本站观点,仅供参考、交流、公益传播之目的。转载的稿件版权归原作者或机构所有,如有侵权,请联系删除。

电话:(010)86409582

邮箱:kejie@scimall.org.cn

生物 脂肪酸 蛋白质纯化

推荐资讯