提高新冠病毒测试的灵敏度?合成RNA来助力

科技工作者之家 2020-08-27

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两个合成的RNA片段,这两个片段的长度大约为4000bp。

在新冠肺炎的检测中,活动性感染需要检测鼻拭子上的病毒基因,但是阴性结果并不一定意味着没有感染。在感染病毒后的头几天,经常出现因病毒载量过低而导致无法检测到病毒基因的状况。

近日,来自美国国家标准与技术研究所(NIST)的研究人员合成了SARS-CoV-2病毒的RNA片段。这种合成材料没有传染性,操作安全,可以帮助制造商研发出更加准确可靠的疾病诊断测试。

NIST的科学家Megan Cleveland说:“更好的测试敏感性数据将帮助我们了解实际应用中,新冠肺炎检测产生阴性结果的频率。”为了解决这个问题,Cleveland等人合成了病毒基因的RNA片段。虽然合成RNA并不是开创性的工作,但 NIST的科学家们能够非常精确地确定每个小瓶中有多少RNA片段。这样,研究人员就可以通过对已知数量的病毒RNA进行测试来测量灵敏度,同时还可以使用它来开发更敏感、快速且容易管理的新型测试方法。

SARS-CoV-2的基因组大约有3万个碱基对,NIST合成的RNA片段则约有4000个碱基对。NIST的研究人员之所以选择合成这些特定的片段,是因为它们含有大量诊断测试所针对的RNA序列。

这些RNA片段被分装在小瓶中并在干冰中包装,同时附有一份数据表,上面列出了这些片段在溶液中的浓度:每微升大约100万份拷贝。 NIST的工作人员使用数字PCR技术多次测量了这个浓度。研究人员可以使用NIST的RNA片段来测量新冠病毒检测的敏感性。为此,他们将NIST的浓缩溶液进行了梯度稀释,然后对每种稀释液进行测试,找到了能产生阳性结果的最低浓度。

除了测量新冠检测的灵敏度,研究人员还可使用合成RNA来开发更敏感的测试或新的测试类型。例如,最近的研究表明,我们可能通过检测城市污水来跟踪新冠肺炎在一个城市的传播路径。NIST的合成RNA能帮助研究人员精确地检测出数百万加仑的废水中极低浓度的病毒。

NIST将这种合成RNA作为“研究级测试材料”发布,并且正在免费向研究人员、测试制造商和测试实验室提供这种材料。材料的技术信息和说明可以在NIST的网站上找到。

“测量灵敏度是测试开发的一个重要部分,”负责新材料开发的NIST研究科学家Peter Vallone说。“我们希望确保人们拥有他们所需的材料和信息,以便进行尽可能精确的测量。”

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编译:花花 

审稿:alone 

责编:Max

原文链接:

https://phys.org/news/2020-08-sensitivity-covid-material-nist.html

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