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来源：昆虫科学
长链非编码RNA是一类不编码蛋白且长度超过200nt的RNA，尽管lncRNA的转录本范围很广，但设置200 nt的阈值就可以将其与其他小的非编码RNA转录本区分开，例如rRNA（核糖体RNA），tRNA（转运RNA），snRNA（核内小RNA），snoRNA（核仁小RNA）和miRNA（微小RNA）。以前，基因组中非编码区的生物学重要性并不明确，因为它们包含大量的转座子，假基因和简单的重复序列。但是，新兴研究表明，lncRNA在关键的生物学过程中可能发挥至关重要的作用。转录组测序和计算方法已被证明可用于非模式生物中lncRNA的系统计数，并且在昆虫基因组中已通过实验验证了一些lncRNA。有趣的是，尽管对昆虫中lncRNA的鉴定和注释进行了深入的研究，但在功能分析方面的研究仍然有限。
白背飞虱（WBPH）、灰飞虱（SBPH）和褐飞虱（BPH）被认为是亚洲最具破坏力的农作物害虫。三个飞虱基因组数据的释放为稻飞虱基因的鉴定和功能分析提供了巨大的资源。在这项研究之前，仅报道了褐飞虱中2439个lncRNA转录本，而在白背飞虱中尚无关于lncRNA的研究发表，根据所研究内容探究的生物信息学方法，本研究确定了WBPH基因组中1852个基因位点编码的1861个lncRNA。分析描述了白背飞虱不同发育阶段的lncRNA表达谱，比较了白背飞虱 lncRNA表达及与其最近的编码蛋白基因表达之间的关系，并探讨了lncRNA可能的调控模式。综上所述，本研究为对lncRNA的特征描述鉴定到了候选者，并提供了有关昆虫发育过程中lncRNA调控的相关信息。
图4 白背飞虱lncRNA的发育表达谱。
（A）热图显示了在8个发育阶段中所有lncRNA的表达水平。E1：胚胎; N1：一龄若虫; N2：二龄若虫; N3：三龄若虫; N4：四龄若虫; N5：五龄若虫; D5：5日龄成虫; D10：10日龄成虫。
（B）显示了不同表达水平的lncRNA和编码蛋白基因的发育表达特异性。X轴代表每个lncRNA和编码蛋白基因的最大JS特异性得分。如Y轴所示的密度表示在密度函数曲线下的面积代表了在x值范围之间获得x值的可能性。
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Chang, Z.X., Ajayi, O.E., Guo, D.Y. and Wu, Q.F. (2020) Genome-wide characterization and developmental expression profiling of long non-coding RNAs in Sogatella furcifera. Insect Science, 27(5), 987–997.
来源：InsectScience 昆虫科学
原文链接：http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIwOTAxMDE2OQ==&mid=2650929576&idx=1&sn=9c9f78d28e4846f3a2d418c681f85f77&chksm=8c8f353ebbf8bc2876e5518b5fbaf4e7402553660aa06816136be456379eb00e80b7019922b8&scene=27#wechat_redirect
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