关于利用基因编辑技术鉴定环状RNA功能的研究

科技工作者之家 2021-01-17

来源:植物科学最前沿

作为一种新兴的植物反向遗传学研究工具,CRISPR-Cas9在植物非编码RNA功能研究中的应用还处于起步阶环状RNACircRNAs)是一类主要的非编码RNA,而它在植物中的生物学作用在很大程度上仍然不清楚。以往对植物CircRNA的研究主要集中在可能的CircRNA识别和注释上,其功能在很大程度上没有用遗传学的方法来鉴定。最近,中国电子科技大学张勇和美国马里兰大学戚益平团队利用CRISPR-Cas9基因编辑技术敲除了一批水稻CircRNA,并鉴定了其生物功能。

研究人员应用CRISPR-Cas9多重编辑策略来有效地获得水稻中四个CircRNAs的敲除突变体。结果表明,水稻CircRNA基因Os02circ25329Os06circ02797Os03circ00204Os05circ02465在原生质体和稳定转基因T0系中的缺失率均达到10%以上。表型鉴定结果显示,这些CircRNA参与了种子萌发过程中的盐胁迫反应,尤其是Os05circ02465缺失突变体表现出较高的耐盐性。值得一提的是,Os06Circ02797突变体的幼苗在种子萌发后表现出较快的生长特性,其叶绿素A/B含量较高。进一步的分子和计算分析结果表明,Os06circ02797CircRNA-miRNA-mRNA调控网络中发挥结合和隔离OsMIR408(植物中一种重要且保守的microRNA)的功能。

该研究不仅首次在植物中提供了某些CircRNA可能负调控miRNAs的遗传证据,而且还为通过编辑CircRNA位点来改良农艺性状提供了新的思路。

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Plant Biotechnology Journal, 13 January 2021

Efficient deletion of multiple circle RNA loci by CRISPR-Cas9 reveals Os06circ02797 as aputative sponge for OsMIR408 in rice

Author

Jianping Zhou, Mingzhu Yuan, Yuxin Zhao, Quan Quan, Dong Yu, Han Yang, Xu Tang, Xuhui Xin, Guangze Cai, Qian Qian, Yiping Qi, Yong Zhang*

*: Department of Biotechnology, School of Life Sciences and Technology, Center for Informational Biology, University of Electronic Science and Technology of China, China

来源:frontiersin 植物科学最前沿

原文链接:http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyOTY2NDYyNQ==&mid=2247507417&idx=6&sn=6793f4e730579423441f6f32b5566688

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基因编辑技术 环状rna circRNA

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