Nature medicine:质谱技术有新用——临床样本的数字化进程

科技工作者之家 2019-11-18

来源:生物谷

近日,来自瑞士的科学家在国际著名生物学期刊nature medicine发表了他们的一项最新研究成果,他们结合压力循环技术(PCT)和SWATH-MS技术提出一种将临床组织样本转换为单个数字文件的方法,应用这种方法对样本的蛋白组学信息进行记录,方便研究人员对样本信息进行反复分析和对比。这一方法的提出对增加临床样本的利用效率具有重要意义。

活体组织检查(biopsy)简称"活检",是指应诊断、治疗的需要,从患者体内切取、钳取或穿刺等取出病变组织,进行病理学检查的技术。这是诊断病理学中最重要的部分,对绝大多数送检病例都能做出明确的组织病理学诊断,被作为临床的最后诊断。活检取出的组织样本一般量比较少,对于病人疾病的检测和诊断非常重要。但每一个临床样本都具有其唯一性,样本的量非常有限并且不可再生。类似于组织活检这样的小样本经常会在一系列检验分析之后被消耗殆尽。

研究人员提出一种结合压力循环技术(PCT)和SWATH-MS技术的方法,能够将小量的组织样本转变成单个,永久性的数字文件,该类文件基于质谱技术,记录着样本的蛋白组学信息,并具有快速和可重复性特点。该方法导出的蛋白质组学图谱文件能够用于不同样本之间特定蛋白质的分析,重分析,对比以进行检测和量化。

研究人员应用这种方法将9名肾细胞癌病人的18个活检样本进行了处理并转换成SWATH-MS片段离子图谱。研究人员从所有样本的蛋白质组学图谱中检测并量化了超过2000种蛋白,具有高度重复性。这些检测出来的蛋白质清晰得将肾脏肿瘤组织与正常的健康组织区分开来,同时也对各种组织形态不同的肾脏肿瘤亚型进行了区分。

综上所述,该项研究提出了将临床样本进行质谱处理分析转换成数字文件的方法,增强了对临床样本的利用效率,具有非常重要的意义。

近年来, 伴随着精准医学的发展,质谱已经成为新生儿遗传代谢病筛查、维生素及激素、治疗药物检测、微生物鉴定、药物毒性和中毒识别等必不可少的工具。

质谱分析作为高端定量检测分析,在检测的灵敏度、特异性、分析速度、多指标同时检测等方面有非常强的优势,临床上可实现对部分传统检测方法的技术替代。初步估计质谱的临床检测将会是一个百亿以上的蓝海市场。目前,临床检测需求快速爆发,临床质谱技术也在不断提高。与此同时,国内临床质谱相关政策也在逐渐完善、出台,多家质谱仪及相关试剂盒有望于2019年陆续获批,临床质谱市场正迎来快速发展机遇。

来源:BIOONNEWS 生物谷

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