常用生物学软件的安装与应用（四）—MEGA

 ↑ ↑ ↑  关注iJournal，选刊快人一步  ↑ ↑ ↑ 

导语：

在做功能基因组学研究时，经常会用到多序列比对，其主要用于描述一组序列之间的相似性关系，以便对一个基因家族的特征有一个简明扼要的了解。前几期小编推送的两个分子生物学软件都可以用于多序列比对，包括SnapGene和DNAMAN。但要说到最强大的多序列比对软件，MEGA肯定是其中之一。因此本期小编就给大家简单介绍MEGA的用法，并对这三款软件的多序列比对功能做一个小结。

图片来源：软件截图

单击菜单【Alignment】→【Alignment by ClustalW】，调整参数（一般用默认参数即可）后点击【OK】，即可完成序列比对。最后单击菜单【Data】→【Save Session】→【MEGA Format】，保存序列比对的结果。

图片来源：软件截图

几款序列比对软件对比

前面提到DNAMAN、SnapGene和MEGA都能做序列比对，各自有其优劣，小编自己总结了3款软件的优势和使用习惯，希望能对读者有所帮助。

（1）DNAMAN的优势在于序列比对的结果图形化显示清晰，可直接用于文章图片中；

（2）SnapGene的优势在于双链显示序列，而且可结合测序图显示，用于测序文件和参考序列的比对时非常方便；

（3）MEGA的优势在于进化分析，可用于成千上万条序列的比对，并且有相应的Linux版本，在大样本的分析中有重要的应用。

图片来源：软件截图

往期好文推荐

（点击下方文字即可阅读）

感觉被导师坑了一把，该怎么办？

读博真相大公开，“自律”使我学术一路“狂奔”！

2021年手握七篇1区论文的我：如何将文章发表在顶级期刊上

今日视频推荐

论文降重技巧第二弹~

点开视频即可了解！

↑↑↑关注“投必得学术”视频号，更多干货↑↑↑

点击“阅读原文”了解投必得业务类型~

请大家点击右下角，

将投必得分享给更多有需要的人