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科技工作者之家 2021-09-06
染色体外环状 DNA (eccDNA) 是指一种环状 DNA,起源于但可能独立于染色体。由于技术进步,eccDNAs 最近已成为具有多种特征的多功能分子。eccDNAs独特的拓扑结构和遗传特征为癌症的监测、早期诊断、治疗和预测提供了新的思路。
EccDNAs 通常在正常细胞和癌细胞中观察到,并且在对外源性和内源性刺激、衰老和致癌作用的应激反应以及癌症治疗期间的耐药性中通过不同的机制发挥作用。eccDNAs 的结构多样性有助于 eccDNAs 的功能和数量多样性,从而通过驱动染色体外位点的遗传可塑性和异质性,赋予 eccDNAs 在进化和癌症发生和进展中的强大作用,EccDNAs 在癌症中显示出巨大的潜力。
2021年9月3日,广东医科大学刘林华团队在Molecular Cancer (IF=27.40)在线发表题为“Small extrachromosomal circular DNA (eccDNA): major functions in evolution and cancer“的综述文章,该综述总结了 eccDNAs 的特征、生物发生、评估的功能、功能机制、相关方法和临床效用,重点是它们在进化和癌症中的作用。
染色体外环状 DNA (eccDNA) 是指源自染色体的环状 DNA,这些 DNA 可能独立于染色体 DNA。位于细胞核中的 EccDNA 于 1964 年由 Alix Bassel 和 Yasuo Hoota首次发现,并被称为double minutes (DMs)。EccDNA 最初是通过核型分析确定为独立于癌细胞中染色体的 DNA,但由于技术进步,特别是下一代测序和生物信息学,其众多特征和功能被确定,因此已成为一种新型分子 。
EccDNAs 足够长以容纳其自身的复制起点,能够编码氨基酸,并且已在肿瘤组织中观察到,在这些组织中,它们最常含有癌基因或与癌症治疗中的耐药性相关的基因。eccDNAs 的其他功能,如衰老功能和异质性,以及推定的作用,包括剂量补偿,已逐渐被发现。已知癌细胞内的基因型多样性和基因组可塑性受基因组不稳定性和基因组改变的影响。
EccDNA 可以通过其多样性(包括结构、功能和数量的多样性)快速重构基因组,从而有效地推动癌症和生命的进化。在这篇综述中,讨论了 eccDNA 功能的特征、生物发生、方法和机制,重点是它们在进化和癌症中的作用。
参考消息:
https://molecular-cancer.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12943-021-01413-8
来源: iNature
原文链接:http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU3MTE3MjUyOA==&mid=2247534966&idx=5&sn=07e40164418ffbb471af3a1ab22db0e8
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