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科技工作者之家 2021-09-15
植物基因组通常较大、高度重复且呈现多种倍性,因而使用短读长测序技术时难以对其进行测序和组装。对长和超长 DNA 片段进行测序时,读长可长达 4 Mb,纳米孔技术能够强化植物基因组组装,从而解析复杂的重复区域、结构变异、转座子和转基因插入。通过对天然 DNA 进行直接、无扩增测序,保留并同步检测修饰碱基及核苷酸序列。
深圳中国科学院仙湖植物园植物研究中心万涛博士与贝纳基因共同合作,利用纳米孔超高通量测序平台PromethION,结合其他测序平台,对裸子植物百岁兰进行染色体水平的基因组组装、甲基化和转录组分析,以探索其生物学特性。研究成果发表在《Nature Communication》。
DOI: https://doi.org/10.1038/s41467-021-24528-4
9月16日,我们邀请到深圳中国科学院仙湖植物园植物研究中心万涛研究员,在线上分享他们利用纳米孔长读长测序平台进行百岁兰基因组研究的经验和成果。
来源:生物谷
原文链接:http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzI2NjY1NjA5Mw==&mid=2247539891&idx=3&sn=79a811fc582124524ab2770d107630c9
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