中国水产科学研究院长江水产研究所发现长江野生鱼肠道内微生物多为“暂住者” 学术资讯

本报讯（见习记者荆淮侨）中国水产科学研究院长江水产研究所（以下简称长江所）的科研人员发现，长江野生鱼肠道内微生物主要来自与鱼类食性相关的环境微生物，它们大多只是匆匆过客（暂住者），和宿主形成稳定适应的常住者相比占比很低。相关研究成果近日发表于《微生物学前沿》。

为了系统理解肠道微生物和环境微生物之间的动态关系，长江所科研人员提出了一个简化的框架来描述肠道微生物的定殖和动态。水生动物在个体发育早期，环境微生物随水体环境和饵料一起通过摄食过程进入肠道。随着个体发育和免疫系统建立，一小部分进入肠道的微生物和宿主之间逐渐建立协同平衡成为肠道微生物定居者，而大部分进入肠道的环境微生物只是匆匆过客，因肠道内环境及免疫过程的过滤而消失或在肠道微生物群落动态竞争演替中消失。所以在成年个体肠道中，微生物是由不断进入肠道的环境微生物和已定居肠道的微生物组成的。

为了量化环境微生物在野生鱼类肠道的定殖状况，研究人员利用16S rRNA基因扩增子测序，对长江武汉段水体环境微生物和10种野生鱼类肠道微生物的群落结构进行分析，量化环境微生物和肠道内微生物之间的关系。

结果确认，在大多数个体中，近80%的肠道微生物和水体环境微生物相同（除了鳜和短颌鲚偏低，约74%）。在约80%的个体中，95%以上的肠道微生物物种和OTU（分类操作单元）属于过客类型。在鱼类物种水平，99%以上的引入肠道的微生物物种和OTU是过客。水体环境微生物中近79%OTUs和89%物种可以被引入鱼类肠道。受临时微生物引入的驱动，具有相似栖息生境和食性的鱼类具有相似的肠道微生物群落。