测序基因分型技术中测序酶切组合的确定方法

• 摘要：

  本发明提供了一种测序基因分型技术中测序酶切组合的确定方法,包括以下步骤:(1)对目的基因组进行限制性内切酶酶切位点预测,统计不同酶切方式获得的酶切片段数目;(2)根据步骤(1)中所预测的各种酶切方式的酶切片段设计每种酶切片段两端的接头序列及PCR扩增引物序列;(3)分别针对不同酶切方式利用GBS技术构建测序文库;(4)利用步骤(3)构建的测序文库进行测序;(5)根据测序结果获得SNP标记位点;(6)根据不同酶切组合所获得的SNP标记位点个数、酶切片段大小确定针对目的基因组的特定酶切组合.

• 专利类型：

  发明专利

• 申请/专利号：

  CN201510660486.6

• 申请日期：

  2015.10.13

• 公开/公告号：

  CN105368930A

• 公开/公告日：

  2016-03-02

• 发明人：

  胡晓湘 王宇哲 曹学敏 李宁

• 申请人：

  中国农业大学

• 主分类号：

  C12Q1/68(2006.01)I,C,C12,C12Q,C12Q1

• 分类号：

  C12Q1/68(2006.01)I,C,C12,C12Q,C12Q1,C12Q1/68

• 主权项：

  一种测序基因分型技术中测序酶切组合的确定方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)对目的基因组进行限制性内切酶酶切位点预测,统计不同酶切方式获得的酶切片段数目;(2)根据步骤(1)中所预测的各种酶切方式的酶切片段设计每种酶切片段两端的接头序列及PCR扩增引物序列;(3)分别针对不同酶切方式利用GBS技术构建测序文库;(4)利用步骤(3)构建的测序文库进行测序;(5)根据测序结果获得SNP标记位点;(6)根据不同酶切组合所获得的SNP标记位点个数、酶切片段大小确定针对目的基因组的特定酶切组合;其中,在步骤(1)中,对目的基因组的酶切位点预测包括单酶切预测和双酶切预测.