一种获取鸡全基因组高密度SNP标记位点的方法

• 摘要：

  本发明属于基因工程技术领域,提供了一种获取鸡全基因组高密度SNP标记位点的方法,包括以下步骤:(1)预测用EcoRI与MseI的双酶切鸡基因组所获得的酶切片段分布情况;(2)根据EcoRI与MseI的酶切片段分布特点设计通用接头、条形码接头及PCR扩增引物;(3)构建简化基因组测序文库;(4)利用步骤(3)构建的文库进行上机测序;(5)根据测序结果获得SNP标记位点.为不同品种的鸡利用双酶切GBS构建全基因组高密度SNP图谱提供了一种通用的策略,使得获取每个SNP标记位点的成本比传统芯片技术降低一个数量级,该方法技术稳定,重复性高.

• 专利类型：

  发明专利

• 申请/专利号：

  CN201510657602.9

• 申请日期：

  2015.10.13

• 公开/公告号：

  CN105238859A

• 公开/公告日：

  2016-01-13

• 发明人：

  胡晓湘 王宇哲 曹学敏 李宁

• 申请人：

  中国农业大学

• 主分类号：

  C12Q1/68(2006.01)I,C,C12,C12Q,C12Q1

• 分类号：

  C12Q1/68(2006.01)I,C,C12,C12Q,C12Q1,C12Q1/68

• 主权项：

  一种获取鸡全基因组高密度SNP标记位点的方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)预测用EcoRI与MseI的双酶切鸡基因组所获得的酶切片段分布情况;(2)根据EcoRI与MseI的酶切片段分布特点设计通用接头、条形码接头及PCR扩增引物;(3)构建简化基因组测序文库;(4)利用步骤(3)构建的文库进行上机测序;(5)根据测序结果获得SNP标记位点.