一种适用于简化基因组测序的建库方法

• 摘要：

  本发明提供了一种简化基因组测序的建库方法,包括在酶切产物两端分别连接通用接头和条形码接头获得连接产物并进行混池;在混池后的连接产物中加入1.2-1.4倍体积的磁珠进行第一纯化获得第一纯化产物;在所述第一纯化产物中加入0.8-0.9倍体积的磁珠进行第二纯化获得第二纯化产物;对第二纯化产物进行PCR扩增获得PCR产物;在PCR产物中加入1.2-1.4倍体积的磁珠进行第三纯化获得第三纯化产物;在第三纯化产物中加入0.8-0.9倍体积的磁珠进行第四纯化获得简化基因组测序文库.该方法能够稳定抓取基因组特定长度片段用于高通量SNP分型的建库,减少PCR过程中短的酶切产物所造成的影响,使得简化基因组测序技术能够在不同内切酶、不同物种中更好的移植和推广.

• 专利类型：

  发明专利

• 申请/专利号：

  CN201510660588.8

• 申请日期：

  2015.10.13

• 公开/公告号：

  CN106567132A

• 公开/公告日：

  2017-04-19

• 发明人：

  胡晓湘 谈成 李宁 黄卓林 任江丽

• 申请人：

  中国农业大学

• 主分类号：

  C40B50/06(2006.01)I,C,C40,C40B,C40B50

• 分类号：

  C40B50/06(2006.01)I,C,C40,C40B,C40B50,C40B50/06

• 主权项：

  一种适用于简化基因组测序的建库方法,其特征在于,包括以下步骤:(a)利用限制性内切酶对猪基因组进行酶切;(b)制备通用接头和条形码接头;(c)分别将通用接头和条形码接头与酶切产物进行连接反应,获得连接产物;(d)将连接产物等比例进行混池,获得混池后的连接产物;(e)在混池后的连接产物中加入1.2‑1.4倍体积的磁珠进行第一纯化获得第一纯化产物;(f)在所述第一纯化产物中加入0.8‑0.9倍体积的磁珠进行第二纯化获得第二纯化产物;(g)对第二纯化产物进行PCR扩增获得PCR产物;(h)在PCR产物中加入1.2‑1.4倍体积的磁珠进行第三纯化获得第三纯化产物;(i)在第三纯化产物中加入0.8‑0.9倍体积的磁珠进行第四纯化获得简化基因组测序文库.