穿山甲是否是新冠病毒的中间宿主？研究结论不一

来源：生物通

穿山甲是新型冠状病毒（SARS-CoV-2）的中间宿主吗？专家至今有着不同意见。一项关于马来亚穿山甲的基因组分析表明，没有证据表明新冠病毒是直接从穿山甲冠状病毒进化而来的。然而，不久前发表在《Nature》上的一项研究却认为，穿山甲可能是新冠病毒的中间宿主。

图片来自Nature

穿山甲是新型冠状病毒（SARS-CoV-2）的中间宿主吗？专家至今有着不同意见。一项关于马来亚穿山甲的基因组分析表明，没有证据表明新冠病毒是直接从穿山甲冠状病毒进化而来的。然而，不久前发表在《Nature》上的一项研究却认为，穿山甲可能是新冠病毒的中间宿主。

华南农业大学的研究团队于5月7日在《Nature》杂志上发文称，从马来亚穿山甲中分离出的冠状病毒与新冠病毒SARS-CoV-2高度相似，表明穿山甲可能是这种病毒的中间宿主。

研究人员在25只马来亚穿山甲（2019年被海关没收）和4只中国穿山甲的肺部组织中搜索与新冠病毒类似的冠状病毒。他们从17只马来亚穿山甲中分离出冠状病毒（Pangolin-CoV），该病毒与SARS-CoV-2有着高度的氨基酸同源性，特别是S蛋白的受体结合域。

华南农业大学的沈永义教授及其同事在论文中写道：“从穿山甲中分离出一种与SARS-CoV-2高度相关的冠状病毒，表明穿山甲有望作为SARS-CoV-2的中间宿主。”

然而，另一组研究人员却得出了不同的研究结论。广东省生物资源应用研究所陈金平研究员领导的团队于5月14日在《PLOS Pathogens》杂志上发文称，没有证据表明新冠病毒是直接从穿山甲冠状病毒进化而来的。

研究人员对来自三只马来亚穿山甲的样本进行了宏基因组测序和de novo病毒基因组组装，收集了38个重叠群，大小在380至3,377个核苷酸。然后他们混合了三个样本的序列，并组装了穿山甲冠状病毒的基因组草图。之后，他们利用扩增子测序填补了空缺，获得近乎完整的基因组序列。pangolin-CoV-2020的基因组共有29,521个碱基。

基因组分析表明，pangolin-CoV-2020与SARS-CoV-2和Bat-CoV-RaTG13有着高度的相关性。pangolin-CoV-2020与SARS-CoV-2之间的核苷酸序列同源性为90.32%，pangolin-CoV-2020与Bat-CoV-RaTG13之间的序列同源性为90.24%，而SARS-CoV-2与Bat-CoV-RaTG13之间的序列同源性高达96.18%。

进一步的分析发现，pangolin-CoV-2020与SARS-CoV-2采用相同的血管紧张素转换酶2（ACE2）受体。不过，研究人员发现，pangolin-CoV-2020、SARS-CoV-2、Bat-CoV-ZXC21和Bat-CoV-ZC45的S基因在序列相似性上并不相同。这些结果表明，这些冠状病毒的进化过程中可能发生了重组事件。

作者在文中写道：“在基因组水平上，SARS-CoV-2与Bat-CoV-RaTG13更为接近，而不是pangolin-CoV-2020。SARS-CoV-2 S基因的系统发育分析和特殊氨基酸序列也不支持SARS-CoV-2直接来源于pangolin-CoV-2020的假说。”

他们指出，尽管这项研究不支持穿山甲是新冠病毒的中间宿主，但结果并不排除其他冠状病毒在穿山甲中传播的可能性。他们补充说，对穿山甲冠状病毒的监测可以阐明冠状病毒在野外的范围，并最大程度减少人类在这些病毒中的暴露。

参考文献

Xiao, K., Zhai, J., Feng, Y. et al. Isolation of SARS-CoV-2-related coronavirus from Malayan pangolins. Nature (2020). https://doi.org/10.1038/s41586-020-2313-x 

Liu P, Jiang J-Z, Wan X-F, Hua Y, Li L, Zhou J, et al. (2020) Are pangolins the intermediate host of the 2019 novel coronavirus (SARS-CoV-2)? PLoS Pathog 16(5): e1008421. https://doi.org/10.1371/journal.ppat.1008421