植物染色质三维构象的深度解读学术资讯

来源：植物科学最前沿

近日，法国巴黎萨克雷大学植物科学研究所Moussa Benhamed教授团队受邀在Journal of Experimental Botany杂志发表了综述型文章—“The Matrix Revolutions: Towards the Decoding of the Plant Chromatin 3D Reality”，该综述深度解读了植物染色质三维构象的最新进展，以及在基因表达调控、生长发育、胁迫响应和农业方面的贡献。

近年来，随着对植物细胞核中三维染色质构象的研究显着增加，染色质构象捕获（3C）及其衍生的相关先进技术的发展，使得探索大型复杂基因组的植物（及农作物）的核拓扑结构成为了可能；随着分辨率的提高也为探究染色质区室化及其相互作用奠定了坚实的基础，为揭示控制植物核结构的高度复杂的机制提供了条件，弥补了该领域的知识空白。此综述在三维空间结构上讨论了探究植物染色体结构的最新技术和对染色质三维空间中基因组的层次结构以及其他核成分的了解，强调了TAD类似结构在植物中的存在，该结构与哺乳动物相应的TAD结构显示出惊人的差异，并提出了ICONS（intergenic condense spacers）的新概念。此外，此综述对染色质环和R-loops的最新研究进展及其在基因活性调节中的意义进行了深度解读。以及讨论了多倍体化对现代农作物染色质拓扑结构的影响和这些生物体中亚基因组的优势和基因保留偏向性等相关现象之间的联系。
法国巴黎萨克雷大学博士研究生黄莹为该文第一作者，此研究受中国国家留学基金委（China Scholarship Council, CSC）资助。

Figure 1. Hierarchical organization of the plant chromatin in the nucleus.

Figure 2. Chromatin configurations in the plant nucleus.

Figure 5. Preferential subgenome interactions in hexaploid wheat.

来源：frontiersin 植物科学最前沿

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