关于植物蛋白翻译后修饰数据库Plant PTM Viewer的研究

科技工作者之家 2020-08-03

来源:植物科学最前沿

近日,Plant Journal在线发表了题为“The Plant PTM Viewer, a central resource for exploring plant protein modifications”的研究论文,公布了植物蛋白翻译后修饰的数据库。

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蛋白翻译后修饰有多重要就不在赘述了,直接告诉你该网站都有点啥,能干点啥,包含来自于5种不同物植物大约370,000个PTM位点的19种蛋白质修饰。

5种植物分别为:

Arabidopsis thaliana : 100,623 PTMs in 41,409 proteins
Chlamydomonas reinhardtii : 17,064 PTMs in 5,324 proteins
Oryza sativa ssp. japonica : 56,606 PTMs in 19,500 proteins
Triticum aestivum : 53,580 PTMs in 25,150 proteins
Zea mays : 143,869 PTMs in 37,099 proteins

该网站还为用户提供了一个蛋白质序列概览,其中突出显示了实验证明的翻译后修饰位点,并估计了置信度,还可以确定实际的修饰位点,以及功能蛋白域或活性位点残基。

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还具有BLAST功能,可以搜索同源序列中的保守翻译后修饰位点,直接粘贴序列就可以了!

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来源:frontiersin 植物科学最前沿

原文链接:https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyOTY2NDYyNQ==&mid=2247498894&idx=2&sn=579c6dcadc9ce83c067dcb57106742e9&chksm=e8bd8e90dfca0786e3163289e07a6b51082134bc782e51604af4e0ed8be22ab35060c12d3a7e#rd

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蛋白质 植物 数据库

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