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科技工作者之家 2020-08-17
来源:中国生物技术网
美国哈佛大学Vijay G. Sankaran等研究人员合作开发出大规模平行单细胞线粒体DNA基因分型和染色质分析方法。这一研究成果于2020年8月12日在线发表在《自然—生物技术》上。
研究人员介绍了一种基于高通量液滴的线粒体单细胞测定法,用于转座酶可及染色质测序(scATAC-seq),该方法结合了数千个单细胞中的高可信度线粒体DNA(mtDNA)突变以及其伴随的高质量的染色质可及性测序。
这样就可以推断出mtDNA的异质性、克隆关系、细胞状态以及单个细胞中可达到的染色质变异。
研究人员揭示了病理性mtDNA变异异质性中的单细胞变异,并将其与个体内部染色质变异性和克隆进化联系在一起。
研究人员克隆地追踪了成千上万的癌症细胞,将表观基因组变异性与亚克隆进化联系起来,并推断出体外和体内分化造血细胞的细胞动力学。
因此,这一方法可以研究体内细胞群体的动力学和克隆特性。
据悉,天然线粒体DNA(mtDNA)突变使得能够推断细胞之间的克隆关系。
mtDNA可以与细胞状态的测定一起进行分析,但尚未与解决人体组织复杂性所需的大规模并行方法相结合。
论文链接:https://www.nature.com/articles/s41587-020-0645-6来源:biotech-china 中国生物技术网
原文链接:https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MjM5ODU5NDgyMg==&mid=2653952904&idx=4&sn=48b8c8a0b051e56b0248ccdd1589ac77&chksm=bd0cebe18a7b62f7a4797cc004711ee145dfa200525af4c8f865e25485bcb71b07d95b52d8c7#rd
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