为液体活检敲警钟?正常女性也存在TP53突变

科技工作者之家 2019-07-05

来源:生物通

随着液体活检的流行,研究人员正在探索是否能够利用从肿瘤上脱落的细胞或DNA来进行癌症检测。不过,华盛顿大学的研究人员在开展此类研究时,却发现未患癌症的女性也存在低频率的TP53突变。

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随着液体活检的流行,研究人员正在探索是否能够利用从肿瘤上脱落的细胞或DNA来进行癌症检测。不过,华盛顿大学的研究人员在开展此类研究时,却发现未患癌症的女性也存在低频率的TP53突变。

研究人员在《Cell Reports》杂志上报道称,这些突变随着年龄的增长而积累,并且与癌症个体中发现的TP53突变相似。这种低频率的TP53突变存在于多个健康的组织中,下至新生儿,上至百岁老人。他们认为这一结果可能对基于液体活检的癌症筛查检测产生影响。

华盛顿大学的Rosa Ana Risques及其同事认为,如今往往以突变作为癌症标志物,但这项研究具有警示意义。“与此同时,随着我们证明高度灵敏的新一代测序方法对于突变检测至关重要,我们也认识到与生物学相关的特异性挑战。

Risques及同事对多名女性的宫颈进行灌洗,并以灌洗液为样本开展双重测序(duplex sequencing)。他们认为这种方法可提高采集效率和突变检测能力。在盲法试验中,他们分析了11名卵巢癌患者和10名健康对照的样本,并正确地鉴定出其中8名卵巢癌患者。

不过,他们在所有女性的灌洗液中发现了低频率的TP53突变,这个结果已经过微滴式数字PCR(ddPCR)的验证。他们指出,这表明这些癌症相关突变并不是癌症特有的,因为也可以在正常组织中发现。

对于未患有癌症的女性样本,研究人员发现TP53突变并非随机分布。他们指出,大约四分之一的突变发生在CpG二核苷酸上(要知道CpG不到TP53编码区的5%),并且突变集中在编码DNA结合域的外显子上。他们认为,这表明突变也存在正向选择。

此外,这些背景TP53突变与癌症数据库中的突变非常相似。研究人员补充说,两组的突变都是错义突变,主要是从G到A和从C到T的转换。

之后,研究人员又将队列进一步扩大,下至新生儿,上至百岁老人。对各种组织样本进行分析后,他们发现TP53突变更频繁地存在于百岁老人的三种组织内。突变类型也随着年龄的增长而变化,因为新生儿的组织更多地携带C和G突变,而老人更有可能携带A和T突变。

研究人员指出,在正常组织中发现与肿瘤相关的突变并不出乎意料,但这可能对癌症筛查产生影响。他们特别提到,以液体活检为基础开发癌症筛查检测的行动应当谨慎。随着突变不断积累,在筛查过程中也许应考虑按年龄调整的阈值。

“我们的结果表明,亚克隆的癌症进化过程是人类正常衰老过程中普遍存在的情况。在诊断癌症时,必须小心区分肿瘤来源的突变和年龄相关的突变,”Risques及其同事在文中写道。

参考文献:

Ultra-Sensitive TP53 Sequencing for Cancer Detection Reveals Progressive Clonal Selection in Normal Tissue over a Century of Human Lifespan


来源:gh_c1fce5726992 生物通

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