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科技工作者之家 2019-09-20
来源:iNature
2019年9月16日,清华大学生命学院的李丕龙课题组,与清华大学医学院的李海涛课题组合作在Molecular Cell上发表题为Histone modifications regulate chromatin compartmentalization by contributing to a phase separation mechanism的学术文章。
于此同时,2019年8月6日,清华大学李丕龙等人在Cell Research杂志在线发表了题为“Multivalent m6A motifs promote phase separation of YTHDF proteins”的研究论文,该研究发现含多价m6A的RNA可以增强体外和细胞中YTHDF蛋白的相分离潜力(点击阅读)。
2019年5月1号,清华大学李丕龙研究团队等人在Nature 在线发表了题为“Arabidopsis FLL2 promotes liquid–liquid phase separation of polyadenylation complexes”的研究论文,该研究结果表明,卷曲螺旋域蛋白可以促进液 - 液相分离,这扩展了我们对控制液体样体内动力学原理的理解(点击阅读)。
真核细胞利用许多膜结合的细胞器来区分生化反应,以便更好地进行空间和时间调节。例如,它们的基因组被封闭在一个膜结合的细胞器中,即细胞核,以便更好地控制遗传信息流。在细胞核内,基因组被进一步调控形成很多区室或区域,这些区室或区域在调节基因表达时起重要作用。从它们的一些特征判断,这些动态实体区室类似于无膜细胞器。许多在染色质区室化中起作用的蛋白质具有LLPS的固有能力。
这些包括之前李海涛/孙前文/李丕龙课题组关于植物中ADCP1的研究,其他还有HP1α,HP1a,CBX2。基于这些观察结果,有人已经提出染色质区室化是通过LLPS形成的。但是之前的研究都无法解释为什么无法自身或与DNA发生相分离的HP1β和HP1γ是如何行使类似的功能,以及组成型异染色质的形成是否受到人缘的三种HP1蛋白通过形成多价复合体与其识别的H3K9me3通过LLPS调节。
图:核小体串上的H3K9me3与HP1复合体的CD的多价相互作用介导的液-液相分离促进异染色质区室的形成
在本次工作中,李丕龙和李海涛课题组合作证明在试管中,H3K9me3修饰与识别其修饰的HP1染色质结构域Chromodomain(CD)的多价态相互作用可导致异染色质的形成。作者使用了两种多价HP1-CD复合体(SUV39H1/HP1, TRIM28/HP1)以及人源细胞核提取物重点染色质片段(NE)、体外重组具有H3K9me3修饰的核小体串(NA)作为实验体系。
几条证据表明这些液滴的形成是由于LLPS介导形成的。由此产生的液滴让人联想到异染色质的动态行为,以及对生化调节和突变表型的反应。作者得出结论,多价H3K9me3/CD相互作用驱动形成的LLPS是细胞中异染色质形成的关键作用力。综上所述,本研究提出了组蛋白标记通过促进LLPS来调节染色体区室化的一般机制。
原文链接:
10.1016/j.molcel.2019.08.019.
来源:Plant_ihuman iNature
原文链接:https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzU3MTE3MjUyOA==&mid=2247504498&idx=6&sn=dfb4cf228391a74728b4a4f365b2a309&chksm=fce6a1adcb9128bbf2999f5622be5bc0e9a5e554daa972959c9b0dab0a8b2d7f79b6cf6c6e42&scene=27#wechat_redirect
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