中国农业科学郑州果树研究所利用基因组测序揭示中国李起源与驯化特征

科技工作者之家 2021-09-03

中国李(Prunus salicina L.)是世界上商业化栽培最广泛的李种之一,适应性强,具有较高的经济价值与生态价值。近日,中国农业科学院郑州果树研究所李杏种质改良团队与桃种质资源团队联合破译了中国李高质量基因组,为其重要经济性状改良奠定遗传学基础,相关成果9月2日发表于《植物学杂志(The Plant Journal)》。  20210903122918_e56ff9.jpg

据论文第一作者黄振宇博士介绍,研究团队首先利用二代、三代及Hi-C等测序技术绘制了李杏种质改良团队自主选育品种‘中李6号’基因组图谱,其组装质量显著优于已有版本,为深度解析中国李基因组变异规律、分子育种及优异基因发掘奠定了重要基础。以此为参考进行全基因组高深度重测序数据分析,74份中国李核心种质可聚类为南、北、东北及国外品种群,南方品种群较为原始,遗传多样性丰富,且与其他品种群间存在基因交流,推测中国李起源于我国南方长江流域。不同品种群间进行选择压分析,共鉴定到35个受选择位点,其中,开花调控、抗病抗逆及类黄酮代谢等重要途径关键基因显著富集,初步揭示了中国李重要性状驯化的分子基础。20210903122919_f9af4b.jpg

该研究是郑果所在“李属基因组计划”方面取得又一重要进展,得到国家园艺种质资源库、国家重点研发计划(2019YFD1000203、中国农科院科技创新工程(CAAS-ASTIP-2021-ZFRI、河南省科技攻关(No.202102110049等项目及平台的资助。

原文链接:

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/tpj.15482

来源: 植物科学最前沿

原文链接:http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzIyOTY2NDYyNQ==&mid=2247522376&idx=1&sn=30c50167fc4b50827c561688b31f489d

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中国李 高质量基因组 经济性状改良

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