新型冠状病毒早期传播动态

科技工作者之家 2020-02-04

来源:前沿科技解读

高福院士用425个确诊NCIP(novel coronavirus infected pneumonia)病例来分析新型冠状病毒早期(7-dec-2019 到 22-jan-2020)动态。

2003SARS和2012中东呼吸综合症与2019-nCoV同属冠状病毒。早期病例多于华南海鲜市场相关,认为野生动物携病毒传给人(可能另有源头)。

早期诊断4原则(根据SARS时期的’未名原因肺炎’监控机制):a发烧38度以上,b做CT有肺炎症状,c低白细胞和淋巴细胞,d抗生素5天治疗无效。(后因为发病过多,d原则改为与武汉人接触即可)

Fig1,12月早期就有,12月29号认为与华南海鲜市场有关,Jan1关闭。未接触海鲜市场的病例指数上升,Jan3通知WHO,Jan8探明病原体,Jan11RT_PCR检测试剂送往武汉(PCR能检测RNA的 specific primier和probe)。Jan13泰国出现病例。Jan23武汉封城市。文章说11Jan貌似拐点,可能是确诊用检测kit等不足。

table1:早期(7-dec-2019 到 22-jan-2020)病患中值年龄59岁,男性56%,当时还没15岁以下小孩。Jan1以前多与华南海鲜市场有关,(Jan12-22)81病患中59个即无华南海鲜市场经历也无病患接触经历。说明海鲜市场非唯一传染源(可人传人),且可能无症状传染者(在潜伏期传染)

Fig3 5clusters家庭成员间传染和发病onset时间,来研究病毒携带者潜伏期等曲线。用log-norm来拟合Fig2A的潜伏期曲线。incubation = 5.2 [4.1, 7.0]天,95th%=12.5天[无症状回京者需要宅家隔离14天,只有不到5%携带者不onset]。

早期serial interval (传染链的连续case时间间隔)= 7.5天, growth rate = 0.1 per day, basic reproductive number R0(平均传染人数)=2.2. R0值大于1代表更多人将患病。随着检测合出现和疾病outbreak R0增加,通过隔离等控制R0下降。SARS时期隔离使得R0由3降到1以下,但是NCIP潜伏期长症状轻携带者多,隔离困难。

Fig2C为’onset-2-就医’时间=5天。Fig2D为’onset-to-留院’ , Jan1前为12.5天,jan1-jan11为9.1天(说明医院效率提高了)。

国家得分resource给医院来测试NCIP,早日确诊医治避免携带者传染更多人。但检测资源等有限。本文10个病例子做图分析,结论未必准确未来待更新。jan22前尚未发现SARS的super spreading event。未来待检查其他国家和城市。人传人在12月中应该开始,此为事后分析,当时都以为和海鲜市场有关,且行政还要考虑恐慌因素等。

来源:fengqi_ox 前沿科技解读

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