【5.20讲座直播】微生物所王军组 – 纳米孔测序解析人类肠道病毒组学术资讯

来源：宏基因组

Oxford Nanopore 的测序技术已成功用于多种应用场景下的宏基因组测序。2020年5月8日，中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室，中国科学院微生物研究所王军教授课题组的曹佳宝博士等人在《Medicine in Microecology》杂志发表了题为“Profiling of Human Gut Virome with Oxford Nanopore Technology”的文章。本文作者利用纳米孔测序，基于纳米孔高通量测序PromethION平台开发出一套用于病毒颗粒物理富集、逆转录、随机扩增来分析人类肠道病毒的工作流程。结果发现使用Nanopore测序病毒DNA和扩增后的病毒DNA/cDNA可获得更长读长的序列，提供有关病毒多样性的更多信息，且许多病毒序列并不在当前数据库中。此外，使用Nanopore测序非扩增的病毒DNA可以对噬菌体的表观遗传修饰（甲基化）信号进行检测。

在此，我们邀请到了本文一作曹佳宝博士在中国时间5月20日下午15:00带来一场在线研讨会，详细介绍本文的研究方法及技术。

研讨会内容人类病毒组在维持肠道微生物组成和功能以及宿主的生理和免疫中起着重要作用。然而，由于病毒（噬菌体和宿主病毒）富集和短读长测序方法的限制，导致这方面的研究还远远不足。至此，我们应用牛津纳米孔技术（ONT）单分子实时测序技术分析了人类肠道病毒组，并对病毒组成和多样性进行研究，同时对噬菌体的甲基化修饰信号进行检测。演讲嘉宾介绍

曹佳宝博士，2019年毕业于中国科学院北京基因组研究，获硕士学位，目前在中国科学院微生物研究所王军教授课题组攻读博士学位，主要研究方向为宏基因组学和三代测序数据的分析。在《Nucleic Acids Research》、《Medicine in Microecology》等杂志发表第一作者或署名作者文章5篇。曾获得中国科学院大学“三好学生”和“硕士研究生国家奖学金”等奖项。
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来源：meta-genome 宏基因组

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